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[健康] 潰瘍性大腸炎とは(レジメ) – 免疫系の異常 [2020/08/26]
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潰瘍性大腸炎

発症率のピークは、男性では、10代後半、女性では、二十歳前後、発症後は、寛解を目指す治療方針です。1日に5から10回の下痢・血便が続く。指定難病97 sourceです。

https://www.nanbyou.or.jp/entry/62

特徴
- 病変の拡がりによる分類
  - 全大腸炎
  - 左側大腸炎
  - 直腸炎
- 病期の分類
  - 活動期
  - 寛解期
- 重症度による分類
  - 軽症
  - 中等症
  - 重症
  - 激症
- 臨床経過による分類
  - 再燃寛解型
  - 慢性持続型
  - 急性激症型
  - 初回発作型
併発
- 関節痛がしばしば見られる
治療

通常は、以下の順序で治療法が変更される。
1. 5-アミノサリチル酸(5-ASA): 抗炎症、経口・直腸投与
  - 従来のサラゾスルファビリジン(サラゾビリン)
  - メサラジン
    ペンタサ
    アサコール(ゼリア) : 腸粘膜の保護, 2009/12
2. 副腎皮質ステロイド : 免疫抑制、経口・直腸投与
  - プレドニゾロン(プレドニン)
3. 血球成分除去療法 : 対外に血液を取り出して異常に活性化した白血球の除去した後、体内に戻す
  - LCAP (白血球除去療法: セルソーバ)
  - GCAP (顆粒球除去療法: アダカラム)
4. 免疫調整薬・抑制薬
  - アザチオプリン
    イムラン
    アザニン
  - 6-メルカプトブリン
    ロイケリン
  - シクロスポリン
    サンディミュン
  - タクロリムス
    プログラフ
5. 生物学的製剤(バイオロジクス; biologics) : 原因の1つ考えられる体内のタンパク質に対するモノクローナル抗体を投与する
  - 抗TNFα受容体拮抗薬
    インフリキシマブ(レミケード)
    アダリムマブ(ヒュミラ)
6. 外科的処置 : 大腸除去
  - 重症例
  - 大量の出血
  - 穴
  - 癌
潰瘍性大腸炎（指定難病９７）- 難病情報センター –
https://www.nanbyou.or.jp/entry/62
2020年8月26日
[PHP] プログラミング – include, require – パス [2020/07/08]
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外部の関数を使うには

プラグインの関数チェック

プラグインの削除/停止で、使いたい関数がなくなったことも考慮して存在をチェックします
```
if ( function_exists( ‘function_in_plugin’ )){ function_in_plugin(); }
```
phpファイルを挿入
- include(), require()の機能
  - include(), include_once(): ファイルが無い場合、警告するが実行停止しない
  - require(), require_once(): ファイルが無い場合、実行停止する
  - その位置に単純挿入
  - 両者で変数を共有できる
- include(/hoge/hoge/file.php), require(/hoge/hoge/file.php)でのパスの設定
  - dirname(__FILE__) : 現在パス
  - $_SERVER[‘DOCUMENT_ROOT’] : blogのルートパス
  - 相対パス : ‘../path/file.php’) : ‘..’はパスを1つ戻ってfile.phpを探す。ない場合は、元パスも探す(らしい)。
  - SERVERの設定
    include_path変数の変更/設定
    set_include_path(hoge/hoge);で初期値を変更可能
    ini_set(‘include_path’, ‘/hoge/hoge’);でも可能
PHPの挙動に関するセッティング

サーバー側の設定です。キャッシュや使用するメモリー容量、その他の細かな設定が可能なようです。僕の場合は、Synology NAS のDSMからWebStationを起動して、script language settingのcoreタグで数値の設定をします。

今現在では、その設定の仕方がよく理解できていません。以下には専門用語(キーワード)を抽出してどのような内容な内容なのか理解を進めている途中です(2021/11/26)。

FPM

FastCGI Process Manger (FPM)は、Synology NASのWebStationからパラメータを設定できます。

FastCGI Process Manager
https://www.php.net/manual/ja/install.fpm.php

APC

APC
https://havelog.aho.mu/develop/php/e167-php-apc-install.html

https://www.php.net/manual/ja/apcu.configuration.php

編集履歴
```
2020/08/25 Mr.HARIKIRI
```
2020年8月25日
[用語] Working Cell Banking
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Working Cell Banking

マスターセルパンク(MCB)の拡大培養により細胞を増やし、MCBと同様に品質試験されて、正式に決定された生産細胞株であるWorking Cell Bank (WCB)を作ること。ルーチン製造に使用される。
```
編集履歴
2020/08/24 Mr.はりきり
```
2020年8月24日
[用語] Master Cell Banking
Post Views: 967
Master Cell Banking

GMPに従いマスターセルバンク(Master Cell Bank; MCB)を製造し液体窒素による超低温保管する。日本、米国、欧州の3つの薬局方(3局)の合意としてICH Q5Dガイドラインがあります。MCBは、「細胞基材」です。その調整にあたり、材料となる元の細胞の履歴、行った作業などについて詳細に記録することが求められます。細胞自体の安定性、産生されるバイオ医薬品の目的物の品質、など多数の試験項目により、MCBの品質を保証する必要があります。

生物薬品（バイオテクノロジー応用医薬品／生物起源由来医薬品）製造用細胞基剤の由来、調製及び特性解析 – ICH Q5D, PMDA –
https://www.pmda.go.jp/files/000156150.pdf
```
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2020/08/24 Mr.はりきり
2021/10/14,追記(ICH Q5D)
```
2020年8月24日
[用語] Cell Banking – ID21614
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Cell Banking

GMPに従いマスターセルバンクとワーキングセルパンクを製造し液体窒素による超低温保管すること。セルバンクには、開発段階ごとに以下のようなものが作成される。
1. Research Cell Bank (RCB)
2. Master Cell Bank (MCB)
3. Working Cell Bank (WCB)
遺伝子組換えしようとしている元の細胞株に遺伝子導入して、目的の物質を生産する遺伝子組換え細胞を作製し、単一のクローンにセレクトしたり、生産性の高いものを選んだりしながら、RCBを作製します。その後、更に、確実なモノクローンにしてMCBを作製します。バイオロジクスの開発段階、臨床の初期段階では、MCBを出発材料として、臨床用サンプルを製造します。その後、MCBの一部を使用して、拡大培養しWCBを作製します。その後は、WCBを使用して臨床用サンプル、商用の医薬品を作製することになります。
```
編集履歴
2020/08/24 Mr.はりきり
2021/10/14,追記(RCB, MCBおよひWCBに関する記載)
```
2020年8月24日
[用語] Screening & Cloning
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目的物質の生産性、生産物の品質、培養容易性、培養安定性の観点からからプール細胞のスクリーニングとモノクローニングすること。

スクリーニングに用いられる評価試験項目は以下の通りです。
- 目的物の細胞あたり生産性(μg/cell)
- 細胞増殖性
- 多世代増殖安定性
- 生産される目的物質の品質試験による目的適合性
- 蛋白医薬の場合、タンパク質に起こる翻訳後修飾として、特にハイマンノース含有率を含む糖鎖の種類及び含有率
```
編集履歴
2020/08/24 Mr.はりきり
2021/10/14,追記(スクリーニング評価試験項目について)
```
2020年8月24日
[用語] Transfection ; トランスフェクション – 遺伝子を細胞内に入れる
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transfection

transfection ; トランスフェクションは、遺伝子組換え技術の基本である目的遺伝子(plasmid)を細胞 (Host Cell)の中に入れる操作です。使用する薬剤として強カチオンを使用したり、薬剤ではなく電気パルスで細胞膜を緩め小さな穴を作って挿入したりする方法があります。

[Bio-Equipment] 遺伝子導入装置 ; Transfection for Plasmid to cells

2020年9月30日 [Bio-Equipment] 遺伝子導入装置 ; Transfection for Plasmid to cells はコメントを受け付けていません

[用語] Transfection ; トランスフェクション – 遺伝子を細胞内に入れる

2020年8月24日 [用語] Transfection ; トランスフェクション – 遺伝子を細胞内に入れるはコメントを受け付けていません

[rAAV-Design] – 治療用AAV Vectorの設計 – 考慮事項 – ID12947 [2020/06/24]

2020年4月8日 [rAAV-Design] – 治療用AAV Vectorの設計 – 考慮事項 – ID12947 [2020/06/24] はコメントを受け付けていません

[rAAV-Production] – 治療用AAV Vector製造 – 考慮事項 – SM-ID12844 [2020/10/14]

2020年3月31日 [rAAV-Production] – 治療用AAV Vector製造 – 考慮事項 – SM-ID12844 [2020/10/14] はコメントを受け付けていません

[Bio-Edu] バイオ医薬品における生産細胞株の構築の方法 – ID5029 △[2020/08/19]

2020年1月11日 [Bio-Edu] バイオ医薬品における生産細胞株の構築の方法 – ID5029 △[2020/08/19] はコメントを受け付けていません

[Data Link] ウイルスベクターによる遺伝子導入と発現(4) – ID4158 [2019/12/09]

2019年12月9日 [Data Link] ウイルスベクターによる遺伝子導入と発現(4) – ID4158 [2019/12/09] はコメントを受け付けていません

[Bio-rAAV] rAAV vector製造でplasmidを細胞に導入するトランスフェクション試薬 – ID3336 [2020/07/21]

2019年11月18日 [Bio-rAAV] rAAV vector製造でplasmidを細胞に導入するトランスフェクション試薬 – ID3336 [2020/07/21] はコメントを受け付けていません
```
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2020/08/24 Mr.はりきり
2021/10/14,追記(電子パルスについて)
```
2020年8月24日
[用語] Host Cell
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Host Cell

目的のタンパク質を発現させるために使用する出発材料となる最適化された細胞のこと
```
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2020/08/24 Mr.はりきり
```
2020年8月24日
[用語] PCL – Packaging Cell Line/Producer Cell Line [2020/08/23]
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Producer Cell LineとPackaging Cell Lineの違い
- Packaging Cell Lineは、キャプシドまたは空のウイルス量子を生産します。遺伝子治療用のウイルス・ベクターを生産するには、GOI Plasmidをトランスフェクションします
- Producer Cell Lineは、GOIの安定生産細胞株であり、長期にウイルス・ベクターを生産します source
プロデューサー細胞株は、遺伝子治療ベクターの製造コンポーネントの1つです。選択した細胞株の特性（起源/派生、倍加時間、ウイルス感染と複製の許容度）はウイルス生産性の効率を決定し、増殖条件は必要な下流の処理方法と最終製剤のリリーステストに影響します。この様式の細胞は、臨床目的によっては、患者に直接投与される可能性もあります。source

FDAガイドライン

遺伝子治療ベクターの遺伝子解析

2018年のFDAドラフトガイドラインの概要です source
- 「40kb以下のすべてのベクターを完全にシーケンスすることを推奨する」
- 「ウイルスベクターを統合するには、統合されたベクターでDNAシーケンスを実行することを推奨する。シーケンシング用の材料は、プロデューサー細胞株から収集できる。」
- 「安定したベクタープロデューサー細胞株(PLC)については、生産終了（EOP）細胞における遺伝子インサートの遺伝的安定性をテストすることを推奨する
対応できる企業
- Ultragenyx
- Vigene Biosciences
  - HEK293-s, HEK293T-s, etc
  - Suspension Cell culture
- Creative Biogene
- Oxgene™️
PCL関連文献リンク
```
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2020/09/03 Mr.HARIKIRI
2020/09/17 追加(対応できる企業の追加;Oxgene™️)
```
2020年8月23日
[用語] エクソン; exon [2020/08/23]
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エクソン

エクソン; exon, DNAまたはRNAがタンパク質に転写されるまでに、スプライシングを受けて実質的に必要な(タンパク質をコードするという意味での)遺伝子配列まで残る部分。

除去される部分をイントロンと呼ぶ。エクソンは、更にタンパク質に翻訳されるコーディング領域(CDS)と、されない領域(UTR; 非翻訳領域)に区別される。開始コドンより上流を5’UTR、終始コドンりより下流を3’UTRという。tRNAにも同様の機構が存在する。
- 5’ UTR
- エクソン
  - CDS
  - UTR
- イントロン
- 3’ UTR
エクソン – wikipedia –
https://ja.wikipedia.org/wiki/エクソン
```
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2020/08/18 Mr.HARIKIRI
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2020年8月23日