タグ: AAV

  • 気になる企業 – Creative Biolabs Inc. はcGMP製造もできるCRO – ID2413 [2020/05/21]

    気になる企業 – Creative Biolabs Inc. はcGMP製造もできるCRO – ID2413 [2020/05/21]

    Creative BioLabs

    Creative BioLabs Incはアメリカに本社を置き.イギリスとドイツにも拠点を持つ.

    前身は2006に設立、2015年にfoundされました。創薬初期のステージで使用する技術としてPhage display,ハイブリドーマ作成などの実施が可能である.カスタムバイオテクノロジーと製薬サービスを提供する.創薬後期のステージで使用するヒト化技術,親和性成熟技術など,高度な分析技術を必要とするサービスも提供できる.を作製できる抗体は,研究用,診断用,治療用の提供が可能.cGMPによるモノクローナル抗体製造は1,000L規模で可能.100名の擁するContract Research Organization (CRO)です.。format変換, identification, affinity maturation, humanizationなどresearch段階での技術は高く、できることは沢山の説明はあります。

    https://www.creative-biolabs.com/immuno-oncology/cell-culture-process-development.htm

    Comprehensive service portfolio including antibody

    • reformatting
      • Fab
      • F(ab)’2
      • scFv
      • VHH
      • minibodies
      • bispecific
    • production
    • epitope binning and mapping
      • identify the epitope
      • elucidate the mechanism
      • strengthen intellectual property
    • humanization
      • variety of methods and toolkits
    • affinity maturation
      • high-throughput phage library
    • affinity measurement
      • kinetic properties
    • sequence liability identification
    • immunogenicity prediction
      • in vitro screening (Sensitive immunogenicity Assessment Technology; SIAT)
      • in vivo screening

    cGMP manufacturing

    • https://www.creative-biolabs.com/immuno-oncology/cgmp-manufacturing.htm
    • microbial
    • mammalian
    • plasmid DNA production and purity
    • Advanced packaging/filling equipment
    • All the upstream and upstream processes use a single system
    • FDA’s formal regulations on the design, monitoring, control and maintenance
    • Code of Federal Regulations (CFR) is the compilation (21)

    Development

    • Culture media screening and adaptation
    • Material preparation for different stages of projects, such as transient and pool material production
    • Various bioreactors available
    • Productivity and/or quality optimization
    • 細胞培養プロセス開発
      • クローン選択から培養条件の最適化
      • 培養開発プラットフォーム
      • 100名以上の専門スタッフ
    • 1L~2,000L cGMP製造
      • Wave
      • Vi-cell
      • YSI
      • Cedex Bio HT
      • Novaflex
      • Bioprofile 400
      • BGA
      • Terumo tubing welder
      • Osmometer
      • Steril tubing
      • welder and sealer
      • Integrity tester
      • Media prep systems for lab & pilot plant

    Product Quality Optimization

    • Aggregation control
    • Charge variant control
    • Glycosylation optimization
    • Sialic acid content optimization
    • ADCC/CDC activity optimization

    Late stage cell culture process development

    • Technical transfer
    • Commercial process development service
    • Process characterization and validation

    IND-enabling cell culture activities

    • Clone selection and process optimization
    • Scale-up and toxicological material production
    • Technical transfer for cGMP production for worldwide IND submissions

    Perfusion and concentrated fed-batch platform

    • High viable cell density and viability
    • For perfusion: long term steady-state operation and stable productivity and quality
    • For concentrated fed-batch: quick adoption from fed-batch with high harvest product titer and improved quality
    • From bench top scale-down model to cGMP anufacturing production

    GENE THERAPY DEVELOPMENT

    Adeno-associated Virus Vector

    様々なHost Cellを提供している

    YB2 / 0細胞株 : フコース含有率が低いラット骨髄腫細胞株

    rcAAVの測定

    委託で測定を受けてくれる。

    Replication-component AAV testing

    Replication-incompetent vector particles derived from AAV (adeno-associated virus) have been shown to mediate transfer and expression of heterologous genes (transgenes) into a variety of cells in vivo and in vitro. It has tremendous potential in both research and therapeutic applications.

    https://www.creative-biogene.com/Services/Custom-Viral-Service/Replication-Competent-AAV-Testing.html
    編集履歴
    2019/09/26 はりきり(Mr)
    2020/05/21 追記(詳細サービス)
    2020/11/24 追記(rcAAV測定)

    以上

  • [rAAV-Lab] AAVの発現・精製から動物試験までの手順をNovagenのAAV精製キット説明書から知る – ID2407 [2019/09/26]

    [rAAV-Lab] AAVの発現・精製から動物試験までの手順をNovagenのAAV精製キット説明書から知る – ID2407 [2019/09/26]

    アイキャッチ by DALL:E3

    はじめに

    AAV vectorを精製するNovagenのキットの紹介です。私たち研究者のナレッジにしてしまいしょう.

    手順は,(1)前培養、(2)トランスフェクシ,さらに(3)後培養(AAV増殖)

    (4)ハーベトス,(5)当該キットによる精製,(6)100kDaのUF膜を用いた濃縮,および(7)除菌ろ過で精製サンプル取得というのが,AAV vector取得の手順です.

    その後,目的のDNAが取得できているか評価するためには(8)AAV vectorからDNA抽出、(9)PCRによる目的遺伝子の確認、(10)動物への投与に至ります.

    Purification of Adeno-associated Virus (AAV) Vectors Using Norgen’s AAV Purification Kit
    NORGEN Biotek Corp.

    AAV Production

    1. 培養条件: HEK細胞と濃度,培養スケール,培地組成
      • Cell seed 10e7 HEK293 cells/15cm plates,
      • DMEM, 10% FBS, 2mM L-glutamine,
      • penicillin/streptomycin
    2. トランスフェクション: 培養1日後に細胞に封入させる遺伝子(pDNA)
      • Transfection (plasmids: rep/cap, genome, helper, containing the inverted terminal repeat (ITR) )after one day
    3. 後培養: トランスフェクション1日後に培地交換
      • Change media after one day, DMEM+L-glutamine (no serum)
    4. ハーベスト: 上清回収は後培養後3~6日
      • Harvest after 3-6days

    AAV Purification

    5. AAVの精製: AAVを増殖させた培養液を用いて精製します.

    • For in vitro and vivo, 300mL of AAV9 containing media
    • 33mL fo 300mL ->Norgen AAV purification kit -> eluate (9.9mL) ->

    6. 濃縮: 遠心型のUF膜を用いた濃縮

    • concentration 100kDa centrifugal filter unit Amicon Ultra-4
    • Collection: 0.5mL

    7. 除菌ろ過 (0.22μm)

    • 吸着が少ないタイプを使用(例えばDurapore)

    DNA Extraction

    8. DNAの抽出:

    • Sample,5μL + 4μL(2 units) DNase (Norgen’s Kit) ->
    • Incubation 37’c for 30min ->
    • EDTA add final 5mM ->
    • Heating 90’c for 20min (inactivation DNase)

    qPCR Quantification

    9. qPCRによる目的遺伝子の確認

    In vitro Transduction with AAV

    10. 動物投与試験: In vivo administration of AAV

    • Purified sample (Concentrated by UF 100kDa)
    • Dilution to 4 x 10e11/0.5mL
    • 2 divided volume
    • 2 mice C57BL/6, ~1 x 10e11/mice
    • mice tissues harvesting 1m post transduction

    文献

    NORGEN: Purification of Aden-associated Virus (AAV Vectors Using  Norgen’s AAV Purification Kit

    編集履歴

    2019/09/26, Mr.HARIKIRI
    2023/11/07, 文言整備

  • [rAAV-DSP] AVB Sepharose High Performance – ID2292 [2019/09/21]

    [rAAV-DSP] AVB Sepharose High Performance – ID2292 [2019/09/21]

    AVB Sepharoseの概要

    吸着可能なAAVの血清型

    • AAV1
    • AAV2
    • AAV3
    • AAV5

    Resinの特性

    • Binding Capacity: >10e12 vg/mL of resin
    • 組換え酵母で作られた蛋白質(14kDa)
    • Resingの安定性: 文献

    概要

    低pH溶出と比較して、高pH溶出および0.5または1.0 Mアルギニンでは、収量は低下したが、アルギニンを含む高pH溶出バッファーは、AAV純度が高くなることを示しており(260/280)、高pH溶出は、低pHでは敏感なウイルスを精製するための代替手段となる。

    Elution bufferの種類

    • EB1 0.1 M sodium acetate, 0.5 M NaCl, pH 2.5
    • EB2 0.1 M sodium acetate, 0.5 M NaCl, 0.5 M arginine, pH 10.0
    • EB5 20 mM Tris-HCl, 2.5 M MgCl2, pH 8.0
    • EB6 0.1 mM sodium acetate, 2.5 M MgCl2, pH 2.5
    • EB7 0.1 M glycine, 0.5 M NaCl, pH 3.0
    • EB8 20 mM Tris-HCl, 0.5 M NaCl, 0.5 M arginine, pH 10.8
    • EB9 1.5 M NaCl, 0.02% (w/v) TweenTM 80, 50% (v/v) ethylene glycol, 20 mM L-histidine, 20 mM CaCl2, pH 6.
    Load Sample/Column information
    • カラム : Tricorn 5/50 (1 mL column volume)
    • レジン : AVB Sepharose High Performance, 1 mL
    • 平衡化バッファ : 20 mM Tris-HCl, 0.5 M NaCl, pH 8.0
    • ロードサンプル : rAAV, 7x10e10 vg/mL x 20 = 1.4x10e12 in Equilibration buffer / 0.2 μm filter, 20 mL
    • 線流速 : 153 cm/h
    • 溶出液評価: AAV ELISA測定
    Study 1
    1. 1st Elution buffer: EB1(recovery 120% of 130% total recovered virus: batch wiseと結果が真逆)
    2. 2nd Elution buffer: EB8 (recovery 6%)
    Study 2
    • Elution buffer : EB3(recovery 72% of 73% total recovered virus
    Study 3
    • Elution buffer : 20mM Tris-HCl, 0.5M NaCVl, 1.0M arginine, pH10.8 (recovery 62% of 64% total recovered virus)

    AVB SepharoseTM High Performance, GE Healthcare

    https://gels.yilimart.com/Assets/Images/doc/file/28411211_DATAFILE_01.PDF

    編集履歴

    2019/09/21, Mr.HARIKIRI

  • [rAAV-Edu] POROS CaptureSelect (AAV精製 resin) の性能とAEXによるfull/emptyの分離 – ID2271 [2019/09/18]

    [rAAV-Edu] POROS CaptureSelect (AAV精製 resin) の性能とAEXによるfull/emptyの分離 – ID2271 [2019/09/18]

    AAVX Resinの特徴

    複数の血清型AAVを吸着

    POROSは、Thermo Fisherのブランドです。以前は独立したメカーでしたが、M&Aで傘下になっています。POROSプランドでAAVをキャプチャー精製する製品は、CaptureSelect(TM)というものがあります、そのラインナップは、AAV8, AAV9, AAVXです。AAVXレジンは特別で、血清型の違いに関係なく高い吸着性能を持っています。すなわち、1つのレジンで精製方法をプラットフォーム化することが可能です。

    これは、抗体医薬で使用されるていProtein Aレジンと同様の位置付けに等しい将来性のあるレジンです。

    • Binding Capacity: >10e14 (vg/mL)

    CaptureSelectとは

    ラクダの重鎖抗体を応用したnonobody技術により、AAVに対する結合性のあるLigandをPorosレジンにカップリングした製品である。

    AAVXレジンの吸着性能をバッチ法で評価

    CaptureSelectのラインナップの内、AAVXは殆どのAAVの血清型に対して高い親和性を有している。

    AAVXレジンと各血清型のAAV (培養、抽出、清澄化したサンプル液)を混合し、チューブ内で10分間の吸着反応させる系で、溶出バッファー(0.1M citric acid, pH2)により回収した溶出液をqPCRでvgを測定し、その回収率を評価している。

    その結果、AAV1(99.63%), AAV2(97.8%), AAV2_HSPG(98.33%), AAV4(98.05%), AAV5(97.88%), AAV6(97.45%), AAV6.2(98.93%), AAV7(98.37), AAV8(97.76%), AAVrh10(96.28%), AAVrh32.33(99.29%), AAV9PHPB(98.51%), AAV7m8(98.39%)、と多数の血清型のAAVを高い効率で吸着・溶出が可能であることが示されている。

    AAVXレジンとその他のレジンとの比較

    比較に使用したレジン

    1. AVB: GE Healthcare
    2. Poros AAV8
    3. Poros AAV9
    4. Poros AAVX

    その結果、下図のように、AABレジンでは、AAV8, AAV9、AAV10を吸着できるものの60%から80%程度の吸着能しかないことが示されている。AABレジンの製品仕様ではAAV1, AAV2, AAV3及びAAV5で使用できるとあることから、当然の結果である。

    AAV2のemptyとfullのHQカラムによる分離

    CsCl2密度勾配の超遠心処理で精製した遺伝子が封入されていないempty AAVと封入されているfull AAVを混和して、AEXカラムであるPOSOR HQカラムにアプライしてクロマトグラフィーを行うと、emptyとfullを分離できる。

    • emptyの溶出位置: 10mS/cm
    • fullの溶出位置: 12mS/cm

    参考文献

    Overcoming downstream purification challenges for viral vector manufacturing: enabling advancement of gene therapies in the clinic: https://pdfs.semanticscholar.org/935c/2e2ee928ba35ebbe22bf43c2e5e1ebe1a4f0.pdf

    Separation of adeno-associated virus type 2 empty particles from genome containing vectors by anion-exchange column chromatography: https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0166093406004022?via%3Dihub

    Review – ラクダが持つ不思議な抗体の魅力:https://harikiri.diskstation.me/myblog/biologics/2300/

    編集履歴

    2019/09/18, Mr. Harikiri
    2021/11/02,記載整備

  • [rAAV] rAAVベクターの精製方法 – Universal Method (2018) – ID2266 [2019/09/18]

    [rAAV] rAAVベクターの精製方法 – Universal Method (2018) – ID2266 [2019/09/18]

    はじめに

    遺伝子治療薬のデリバリー・システムとしてAAV使用が盛んです。今後は、AAVの精製についても抗体医薬と同様に精製方法のプラットフォーム化が進むと予想されます。それを目指して精製関連機材メーカーは、意欲的な製品を発表しているところです。

    ここでは、AAVの精製方法について情報を集めてみたいと思います。現状が把握できれば、今後の方向性も自ずと見えてきます。

    文献の内容

    AAVの血清型に依存しないプットフォーム化された精製方法に関する文献

    GE HealthcareのAVB SepharoseとPOROSの CaptureSelect AAV8及びAAV9の比較

    トリビア: 欧州で開発された最初の遺伝子治療薬Glybera (AAV1-LDL)

    Affinity精製の不利な点は、遺伝子が封入の有無(Empty/Full)にかかわりなく精製されること。

    AEXは、EmptyとFullの分離が可能であり、微妙な電荷の違いが存在することを示唆している。

    この文献では、AffinityとAEXを使用することで精製プラットフォームを提案している。

    Affinity精製サンプルのAUC分析では、多数のピークが確認され、Full以外のEmptyやその他のCapcid蛋白質などの不純物が多く含まれていた。

    Affnity後のAEX精製サンプルのAUC分析(UVモニター)では、1つの主ピークを認め、精製度が上がっている画分は、AEXのクロマトプロファイルとしてA260/A280比は、1を超えておりFull画分と考えられた。

    編集履歴
    2019/09/18 はりきり(Mr)
    2020/06/12 整備(Gutenberg blockに変換)

    精製方法の骨格

    Affinityクロマト→イオン交換クロマト

    対象文献

    Universal Method for the Purification of Recombinant AAV Vectors of Differing Serotypes, 2018

    https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5767896/pdf/main.pdf

    参考文献

    AVB SepharoseTM High Performance, GE Healthcare

    https://www.gelifesciences.co.jp/catalog/pdf/28920754ab.pdf

    アデノ随伴ウイルス精製用アフィニティー担体 – GE Healthcare –

    https://www.gelifesciences.co.jp/catalog/1259.html

    POROSTM CaptureSelectTM AAV Resins: AAV8, AAV9, AAVX – Thermo Fisher –

    https://assets.thermofisher.com/TFS-Assets/LSG/manuals/100038399_POROS_CapSel_AAV8_AAV9_Resins_UG.pdf

    Enabling Custom Solutions for Downstream Processing for Future Therapies: AAV Case Study, BioProcess International, 2016 – bioprocess international –

    https://bioprocessintl.com/ask-the-experts/aav-case-study-poros-resins-captureselect-ligand-webcast/

    編集履歴

    2019/09/18, Mr. Harikiri
    2021/11/02,記載整備

  • [Data Link] 「遺伝子治療製品の過去・現在・未来」H27 – ID2218 [2019/09/15]

    [Data Link] 「遺伝子治療製品の過去・現在・未来」H27 – ID2218 [2019/09/15]

    平成27年度 国立薬品食品衛生研究所シンポジウム 「新しい法律に基づくレギュラトリーサイエンス􏰀推進」
    ー医薬品医療機器等法、健康・医療戦略推進法ー
    遺伝子治療製品􏰀過去・現在・未来

    http://www.nihs.go.jp/oshirasejoho/symposium/documents/H27_suraido_3.pdf
  • [rAAV-Edu] AAVベクターに関する「生物多様性影響評価書」の作成 – [2019/09/15]

    [rAAV-Edu] AAVベクターに関する「生物多様性影響評価書」の作成 – [2019/09/15]

    ID2177

    生物多様性影響評価書

    rAAVなどを用いた遺伝子治療による治験を予定している場合、当局申請のための生物多様性影響評価書の作成が必要である

    生物多様性影響評価書の記載内容は以下の通りである。

    • 自然界における分布
    • 歴史
    • 特性
    • 調製方法(作り方)
    • など

    参考文献

    カルタヘナ法の「第一種使用規程承認申請書」及び「生物多様性影響評価書」に関する作成ガイダンスの策定

    https://www.amed.go.jp/news/seika/kenkyu/20191127-02.html

    pmdaによる生物多様性影響評価書の作成ガイダンス

    https://www.pmda.go.jp/files/000221590.pdf

    カルタヘナ法

    https://www.biodic.go.jp/bch/cartagena/s_05.html

    生物多様性影響評価書の具体例

    AAV-hAADC-2 (自治医大) 生物多様性影響評価書

    https://www.amed.go.jp/news/seika/kenkyu/20191127-02.html

    ネットにあった生物多様性影響評価書の実例(AAV vector)

    https://www.mhlw.go.jp/shingi/2006/02/dl/s0201-5e2.pdf