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タンパク質の濃度
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分子量が小さいタンパク質であれば、簡易的にはA280nmの値が1であれば、1mg/mLとしている。この場合、急行係数とい値は、1.0である。分子量が大きくなってくると、それでは誤差が大きくなってくる。
分子量が大きい抗体では、吸光係数は、1.5付近であり、理論式が提唱されているので、アミノ酸配列が分かっている場合は、それを使って計算する。
Paceの方法
εM = Trp x5500 + Tyr x 1490 + Cystine x 125 [A280/mol/cm]
Protein Sci,1995 Nov;4(11):2411-23. doi: 10.1002/pro.5560041120. How to Measure and Predict the Molar Absorption Coefficient of a Protein. C N Pace 1, F Vajdos, L Fee, G Grimsley, T Gray
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8563639/
Gill & Hippelの方法
εM = Trp x 5690 + Tyr x 149 + Cystine x 120 [A280/mol/cm]
Calculation of Protein Extinction Coefficients From Amino Acid Sequence Data. S C Gill 1, P H von HippelAffiliations expandPMID: 2610349, DOI: 10.1016/0003-2697(89)90602-7
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/2610349/
編集履歴
2019/05/27 はりきり(Mr)
以上
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