カテゴリー: BIOLOGICS

[Bio-Edu] 細胞・細菌・ファージ・マイコプラズマ・ウイルスの大きさ — ID11542 [2020/05/23]
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ID11542
はじめに
バイオロジクス研究を志す者として、必要となる関連知識は沢山あり、且つ学際的です。色んな事柄を知っておく事は、とにかく重要です。
今回は、バイオロジクスの遺伝子組換えのホスト細胞としてよく使われる動物細胞を基準に、疾病の原因であるウイルスやホスト細胞としても良く使われる大腸菌などの大きさを確認しておきましょう。
生物ごとの大きさ(1)
細胞、細菌、ウイルス、ファージの大きさは、一言で以下の通りです。
単位
3桁毎の単位として、m(ミリ)の1/1,000はμ(マイクロ)、μの1/1,000はn (ナノ)です。m(メーター)の1/1,000を表すのにmm(ミリメーター)とします。以下、μとnを使って、それぞれからの1/1,000を表します。

1mm = 1,000μm = 1,000,000 nm
大きい > 細胞 > 細菌 > ファージ > ウイルス > 小さい
cell microbial phage
病原体：ウイルスと細菌と真菌（カビ）の違い — 大幸薬品
https://www.seirogan.co.jp/fun/infection-control/infection/dengerous_pathogen.html
生物ごとの大きさ(2)
実は、これら以外に、真菌、マイコプラズマ、リケッチア、ファージも役者として追加してみます。
真菌の形は、球菌 (球状)､桿菌 (棒状)、らせん菌 (らせん)などと色々あるため、大きさを定めのは難しいですが、細胞あたりの大きさに設定しました。
- 大きい
- 細胞(10μm) | 真菌
- 細菌(5μm)
- ファージ(0.025μm ~ 0.2μm)
- マイコプラズマ(0.2μm ~ 0.8μm)
- リケッチア (0.1μm ~ 2μm)
- ウイルス(0.02μm (20nm) ~ 0.1μm)
- 小さい
大きい > 細胞 | 真菌 > 細菌 > ファージ > マイコプラズマ > リケッチア > ウイルス > 小さい
以上、ウイルスと細菌の大きさの違い – 秋田大学　大学院医学系研究科・医学部 – より
http://www.med.akita-u.ac.jp/~doubutu/kansensho/virus17/virus2-2.html
リケッチアを含む「微生物」の大きさ
臨床微生物学基礎編より
http://www.kankyokansen.org/common/fckeditor/editor/filemanager/connectors/php/transfer.php?file=/publication/edu_03_pdf/uid000001_332D325F32332E706466
3 マイコプラズマの検出と除去・予防 – より
最小の自由生活・自己複製微生物、大きさ: 0.2μm~0.8μm、細胞質を持たない単純な原核細胞、180種類以上が確認されている
http://www.lonzabio.jp/pdf/mycoplasma.pdf
微生物の特徴
実利増殖遺伝子核膜細胞壁
ウイルス無 DNA or RNA 無無
細菌有 DNA 無有(まれに無)
真菌有 DNA 有有
原虫有 DNA 有無
目でみる真菌症シリーズ2
http://www.pf.chiba-u.ac.jp/medemiru/me02.html
細菌を包んでいる膜
- グラム陽性菌 (菌の内側から)
  - 分厚い「細胞膜」: リポタイコ酸、タイコ酸
  - 薄い「細胞膜」 : 二重膜
- グラム陰性菌 (菌の内側から)
  - 薄い「外膜」 : 二重膜(ポーリン孔、リポ多糖)
  - 薄くて弱い「細胞壁」: ペリプラスム空間
  - 薄い「細胞膜」: 二重膜
大腸菌
実験者の間では、E.coli(いーコリー)と言ったりもします。
遺伝子組換えに使用される大腸菌は、グラム陰性菌です。組換え産生タンパク質は、ペリプラスム空間に溜まる場合は、比較的、立体構造を保っている場合があります。
臨床微生物学基礎編
http://www.kankyokansen.org/common/fckeditor/editor/filemanager/connectors/php/transfer.php?file=/publication/edu_03_pdf/uid000001_332D325F32332E706466
臨床微生物学基礎編
https://www.med.kindai.ac.jp/transfusion/ketsuekigakuwomanabou-252.pdf
まとめ
生物は細胞で作られています。細胞は一つの生命活動の単位です。その細胞内に似ているものの生物としてヒトや動物を形作らい面々がいます。一般的に病原体と呼ばれています。
これらは、細胞に似ているから病原体になるのかもしれません。
この解説では、以上のような背景を踏まえて、それぞれの大きさいを比較しました。
以上
編集履歴
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2020/03/07 はりきり(Mr)
2020/05/06 追記 (生物ごとの大きさ(2))
2020/05/09 文言整備
2020/05/23 追記 (真菌、大腸菌)
2021/10/31 追記 (単位の説明を修正)
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2020年3月7日
[BIo-Equip] ACQUITY UPLC H-Class PLUS Bio – Waters – 分析用液体クロマトシステム – ID11528 [2020/03/06]
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ACQUITY UPLC H-Class PLUS Bio
抗体
抗体の定量は、Protein AカラムをUPLC又は、HPLCに接続して行う。
1. Load Sample : 培養上清
2. 平衡化バッファー
3. 溶出バッファー(酢酸、ギ酸)
4. 再生バッファー(クエン酸)
5. 平衡化
Introducing the ACQUITY UPLC PLUS Series – Waters
https://wvmc.waters.com/plus/?xcid=ppc-ppc_00655
関連

[Bio-Equip] キャピラリー電気泳動システム – PA 800 Plus – SDS-PAGEおよびIEX分析
2020年6月8日 [Bio-Equip] キャピラリー電気泳動システム – PA 800 Plus – SDS-PAGEおよびIEX分析はコメントを受け付けていません

[Bio-Equip] SoloVPE – 高濃度タンパク質の無希釈測定 – GMP対応
2020年6月8日 [Bio-Equip] SoloVPE – 高濃度タンパク質の無希釈測定 – GMP対応はコメントを受け付けていません

[BIo-Equip] ACQUITY UPLC H-Class PLUS Bio – Waters – 分析用液体クロマトシステム – ID11528 [2020/03/06]
2020年3月6日 [BIo-Equip] ACQUITY UPLC H-Class PLUS Bio – Waters – 分析用液体クロマトシステム – ID11528 [2020/03/06] はコメントを受け付けていません

[Bio-Equip] Imaged cIEF and CE-SDS – proteinsimple – ID11524 [2020/03/06]
2020年3月6日 [Bio-Equip] Imaged cIEF and CE-SDS – proteinsimple – ID11524 [2020/03/06] はコメントを受け付けていません
```
編集履歴
2020/03/06 Mr.HARIKIRI
```
2020年3月6日
[Bio-Equip] Imaged cIEF and CE-SDS – proteinsimple – ID11524 [2020/03/06]
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Maurice
バイオ医薬品の同一性、純度、および不均一プロファイルの再現性分析と定量分析を行うことができます。サンプルあたり15分以内で迅速に結果を得られます。
- cIEF（キャピラリー等電点電気泳動）
- CE-SDS（キャピラリーSDSゲル電気泳動）
cIEFとCE-SDSを一台で
https://www.proteinsimple.jp/ice_overview.html
関連

[Bio-Equip] キャピラリー電気泳動システム – PA 800 Plus – SDS-PAGEおよびIEX分析
2020年6月8日 [Bio-Equip] キャピラリー電気泳動システム – PA 800 Plus – SDS-PAGEおよびIEX分析はコメントを受け付けていません

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[BIo-Equip] ACQUITY UPLC H-Class PLUS Bio – Waters – 分析用液体クロマトシステム – ID11528 [2020/03/06]
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[Bio-Equip] Imaged cIEF and CE-SDS – proteinsimple – ID11524 [2020/03/06]
2020年3月6日 [Bio-Equip] Imaged cIEF and CE-SDS – proteinsimple – ID11524 [2020/03/06] はコメントを受け付けていません
```
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2020/03/06 Mr.HARIKIRI
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2020年3月6日
[Bio-Equip] WAVE 25 Rocker – GE – ID11509 [2020/03/06]
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WAVE 25 Rocker
ロッキング型のバイオリアクター。25Lまで培養可能。
ReadyToProcess WAVE 25 Rocker – GE Healthcare
https://www.gelifesciences.com/en/sg/shop/cell-culture-and-fermentation/rocking-bioreactors/systems/readytoprocess-wave-25-rocker-p-05542
- wave 25 rocker
関連

[Bio-Equip] WAVE 25 Rocker – GE – ID11509 [2020/03/06]
2020年3月6日 [Bio-Equip] WAVE 25 Rocker – GE – ID11509 [2020/03/06] はコメントを受け付けていません

[Bio-Equip] Flexsafe RM – Wave Bioreactor シングルユースバッグ – Sartorius – ID11421
2020年3月6日 [Bio-Equip] Flexsafe RM – Wave Bioreactor シングルユースバッグ – Sartorius – ID11421 はコメントを受け付けていません

[Bio-Process] 拡大培養/Subculture – ID9342 [2020/02/01]
2020年2月1日 [Bio-Process] 拡大培養/Subculture – ID9342 [2020/02/01] はコメントを受け付けていません
2020年3月6日
[Data Link] バイオロジクス – ろ過膜の基礎知識 (AsahiKASEI) – ID11483 [2020/03/06]
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膜の基礎知識
膜ろ過の方式
膜の基礎知識 – AsahiKASEI
https://www.asahi-kasei.co.jp/membrane/microza/jp/kiso/kiso_3.html
2020年3月6日
[Bio-Equip] Zeta Plus – 培養上の清澄ろ過 – 3M – ID11472 [2020/03/06]
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Bio-Equipment-Harvest
Zeta Plus
細胞と培養上清を分離する工程である
スモールスケールでは、ろ過膜によりハーベストを実施する。5000L以上の培養スケールでは、連続遠心機が使用される
Zeta PlusTM シングルユース吸着デプスフィルター製品 – 3M
https://multimedia.3m.com/mws/media/983784O/cun-p15.pdf
3M Zeta Plus
関連

BIOLOGICS
[Bio-Equip] Zeta Plus – 培養上の清澄ろ過 – 3M – ID11472 [2020/03/06]
2020年3月6日

BIOLOGICS
[Bio-Equip] Pod Filter System – 培養液清澄ろ過 – Millipore – ID118625 [2020/03/03]
2020年3月3日
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編集履歴
2020/03/06 Mr.HARIKIRI
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2020年3月6日
[Bio-Equip] Flexsafe RM – Wave Bioreactor シングルユースバッグ – Sartorius – ID11421
Post Views: 391
Flexsafe(R) RM
Wave培養用シングルユースバッグ
Flexsafe® RM
Disposable Cultivation Chambers for Rocking Motion Bioreactors
Flexsafe® RM
Disposable Cultivation Chambers for Rocking Motion Bioreactors
https://www.sartorius.com/resource/blob/58506/96438c46c1d8d0cfc897509d0c7941b9/data-flexsafe-rm-sbt2013-e-data.pdf
Biostat® RM and Flexsafe® RM for Seed Production and Small-scale Protein Supply
http://sartorius-sd.com.ua/files/Bioreactors/onetime_bioreactors/Broch_Biostat-RM.pdf
Allegro™ MVP Single-Use System
https://shop.pall.com/us/en/biotech/single-use-solutions/automated-systems/allegro-mvp-single-use-system-zidhlieud7s
```
編集履歴
2020/03/06 Mr.HARIKIRI
```
2020年3月6日
[Bio-Equip] Erlenmeyer Flask – 初期培養用フラスコ – ID11424 [2020/03/06]
Post Views: 370
フラスコ培養
セル・バンクの融解から始める初期の培養に使用
```
編集履歴
2020/03/06 Mr.HARIKIRI
```
Erlenmeyer Flask – IWAKI
http://www.iwakiglassindonesia.com/jp/product/erlenmeyer-flask-glass-stopper
2020年3月6日
[Bio-Equip] Vi-CELL XR – 性細胞数を測定 – BeckMan Coulter – ID11412 [2020/03/06]
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Vi-CELL XR
トリパンプルー染色法を用いた培養細胞の生死細胞を自動的に分析してする自動装置です。サンプルをカップに入れるだけで細胞の染色から解析データの印刷までを全自動で行います。
従来の光学顕微鏡と血球計算板を用いる方法を自動化する装置であり、同時に10サンプルの測定が可能です。
Supplier
BeckMan-Coulter
測定項目
- トータル細胞数
- 細胞濃度
- サイズ分布
- 細胞の生死判定
- 生存率
- 生細胞濃度
機能
- アクセス制限
- 監査城跡
- 21 CFR Part 11対応
- 品質確認(PQ)
生死細胞オートアナライザー
Vi-CELL XR – BECKMAN COULTER
https://ls.beckmancoulter.co.jp/products/cell-counting/vi-cell
```
編集履歴
2020/03/06 Mr.HARIKIRI
```
2020年3月6日

クラウドファンディングの紹介 – 大阪大学発ベンチャー「ビズジーン」- 新型コロナウイルス感染症の “使い切り検査キット” – [2020/03/05]

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ID11374

ビズジーン

日本の大阪大学発ベンチャー「ビズジーン」がコロナウイルス検査キット開発に対して資金を募ってます。#コロナウイルス　#検査キット　#ビズジーン

実証試験の第一層試験までの目標資金300万円は、14時間で得られたようです。これらの検査薬の実証試験は、医薬品と同様のスタイルで実行する必要があるため、今後、第二層試験、第三層試験と進める必要があります。

そのような理由から、ファンディングは継続されています。

一部報道にあるように、国立感染症研究所は、ビズジーンに対してコロナウイルス株の提供を拒んでいるとの事ですが、なぜなのでしょうか?

でも、いずれはコロナウイルス株も入手されて、コロナウイルスの検査キットはできあがるものと信じています。

2020/03/05 はりきり(Mr)

株式会社ビズジーン

VisGene Co., Ltd.
代表者 : 開發　邦宏
住所大阪府茨木市美穂ケ丘8-1 大阪大学産業科学研究所
URL : http://visgene.com/
設立 : 2018/04
大阪大学産業科学研究所での研究成果の実用化
共同研究 : 大阪大学微生物研究所、国立感染症研究所、タイ保健省(デング熱でのキット開発)
デング熱は、世界で毎年3.9億人が感染している

クラウドファンディングの内容

タイトル：新型コロナウイルス：使い切りの”簡易検査キット”開発への一歩を

URL：https://readyfor.jp/projects/visgene01
公開期間：2020年2月28日（木）〜4月17日（金）23時
リターンについて：3000円から100万円まで全10コースから支援が可能です。
リターンはサンクスメール、報告書などで、
今回開発する簡易検査キットはリターンには含まれません。
目標金額：300万円
※本件は目標金額を達成した場合のみ、実行者が支援金を受け取ることができるALL-or-Nothing形式です。

クラウドファンディング・サービス体

◾　READYFOR株式会社とは　https://corp.readyfor.jp/

READYFOR株式会社は、「誰もがやりたいことを実現できる世の中をつくる」をビジョンに日本初・国内最大級のクラウドファンディングサービス「READYFOR」を運営しています。2011年3月のサービス開始から1.3万件以上のプロジェクトを掲載し、58万人から約100億円の資金を集め、国内最大級のクラウドファンディングサービスとして、中学生から80代の方まで幅広い方々の夢への一歩をサポートしています。（2020年2月時点）「カンブリア宮殿」をはじめ様々なメディアに掲載され、2016年6月サービス産業生産性協議会が主催する第1回日本サービス大賞優秀賞を受賞。
下記、参考記事よりREADYFORについて抜粋。

参考

特徴の比較(ビズジーン : PCR)

項目	ビズジーン	PCR
測定時間	15分	6時間
同時測定	1検体/キット	1~96検体
原理	核酸クロマト (相補遺伝子配列による補足)	核酸増幅 (1つあれば増幅可能)
検出感度	低い	高い
検査の適用時期	感染初期を除く確定判定	極初期からの確定判定

記事

新型コロナウイルス感染症：使い切りの “簡易検査キット” 開発へ、クラウドファンディングサービス「READYFOR」にて支援募集を開始。　- JIJI.COM より
https://readyfor.jp/projects/visgene01

【阪大ベンチャー】ビズジーン新型コロナウイルス肺炎「15分簡易検査キット」開発したが、感染研がウイルス株提供せず　- かんKANSAI SANPO BLOG より
https://kansai-sanpo.com/visgene02/

新型コロナウイルス：使い切りの”簡易検査キット”開発への一歩を　- READYFOR より
第一目標達成のお礼 (3/1追記)
https://readyfor.jp/projects/visgene01

2020年3月5日

	実利増殖	遺伝子	核膜	細胞壁
ウイルス	無	DNA or RNA	無	無
細菌	有	DNA	無	有(まれに無)
真菌	有	DNA	有	有
原虫	有	DNA	有	無

カテゴリー: BIOLOGICS

はじめに

生物ごとの大きさ(1)

生物ごとの大きさ(2)

微生物の特徴

細菌を包んでいる膜

まとめ

編集履歴

ACQUITY UPLC H-Class PLUS Bio

抗体

関連

Maurice

関連

WAVE 25 Rocker

関連

膜の基礎知識

膜ろ過の方式

Bio-Equipment-Harvest

Zeta Plus

関連

Flexsafe(R) RM

フラスコ培養

Vi-CELL XR

Supplier

測定項目

機能

ビズジーン

株式会社ビズジーン

クラウドファンディングの内容

クラウドファンディング・サービス体

参考

特徴の比較(ビズジーン : PCR)

記事