[Bio-Edu] タンパク質(蛋白質)の精製 – 基礎編 – 不純物の定義、RefoldingからUF膜精製、タンパク質精製の定石まで – そしてタンパク質を知る – ID686 △[2021/06/03]

タンパク質の性質を知ること

PDB

結晶解析により立体構造がわかっているタンパク質の場合、のプロテイン データペースに登録されています。

立体構造から、そのタンパク質の物性イメージをつかみます。

• FabとIL-6のComplex : PDB
• Fab (Rontlizumab) – Interferon-a2 : PDB
• Infliximab (Fab) : PDB
• AAV 5 : PDB

Helical Wheels

アミノ酸が連なったものがペプチドであり、タンパク質です。その構造は、αヘリックス、ベータシート、ランダムシートに分けられます。そのアミノ酸の結合具合をαヘリックスの配置に模倣して、そのドメインがどのようなアミノ酸群、すなわち、疎水性や極性を持っているのかを、単位として理論的に簡略化する図が、Helical Wheelsです。

どの当たるのアミノ酸配列が、

Analysis of individual sequences

http://www.bioinfo.org.cn/lectures/index-7.html

Helical Wheel

https://en.wikipedia.org/wiki/Helical_wheel

解析ソフトの解説も参考になります。

4.14.12 Helical Wheel – HULINKS –

https://www.hulinks.co.jp/support/gi/tutorial/m041412.html

まとめ

この投稿では、タンパク質についてどのような精製があるかを解説した。実際に精製しようとすると、その具現化がまた骨の折れる作業となる。

編集履歴

2019/07/11 はりきり(Mr)
2020/05/09 文言整備
2020/06/13 追記(平膜とボローファイバーの比較)
2020/07/07 Update
2021/06/03,追記(Helical Wheel)