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  • [用語] Lentivirus; レンチウイルス – ウイルスベクター [2020/11/14]

    [用語] Lentivirus; レンチウイルス – ウイルスベクター [2020/11/14]

    レンチウイルス

    • 80~100nmのエンベロープウイルス
    • RNAウイルス
    • レトロウイルス属
    • レトロウイルスに特徴であるgag、pol、env遺伝子を持つ。たたじ、2つの調節遺伝子のtatとrevを持つ
    • 逆転写酵素とインテグラーゼをカプシド内に輸送する事がで、それらタンパク質は、RNAと結合する
    • 逆転写酵素は、ウイルスRNAからDNAを複製する
    • インテグラーゼは、複製されたDNAにLTRを付加し、宿主DNAにインテグレーションさせる
    • Tatは、転写中にトランスアクチベーターとして機能し、開始と伸長を促進させる。
    • Rev応答エレメントは転写後に作用し、mRNAスプライシングと細胞質への輸送を調節する
    • 類人猿、サル、キツネザル、マレーヒヨケザル、ウサギ、フェレット、牛、山羊、馬、猫、羊に生息が確認されている
    • 5つの血清型は、霊長類、羊および山羊、馬、飼い猫、および牛に対応
    • エイズを引き起こすヒト免疫不全ウイルス(HIV)である
    • DNAへのcDNAは、非分裂細胞に効率的に感染する可能性があるため、遺伝子送達の最も効率的な方法の1つです。[2] レンチウイルスは内因性(ERV)になり、そのゲノムを宿主の生殖細胞系列ゲノムに統合することができるため、ウイルスは今後、宿主の子孫に受け継がれます。

    レンチウイルス – Wikipedia –

    https://translate.google.co.jp/translate?hl=ja&sl=en&u=https://en.wikipedia.org/wiki/Lentivirus&prev=search&pto=aue
    編集履歴
    2020/11/14 Mr.Harikir
  • [用語] Poliovirus; ポリオウイルス – 腫瘍溶解性 [2021/02/06]

    [用語] Poliovirus; ポリオウイルス – 腫瘍溶解性 [2021/02/06]

    ポリオウイルス

    脳のグリア細胞に感染するウイルス。数%で弛緩性麻痺を引き起こす。

    • 直径30nm、RNAウイルス
    • 約7,500bpからなる1本鎖RNA(ssRNA)のブラス鎖ゲノム
    • プラス鎖RNAを鋳型としてマイナス鎖RNAが複製される
    • マイナス鎖RNAから多数のプラス鎖RNAが合成され、カプシドに封入され、娘ウイルス粒子が完成し、細胞外に放出される
    • エンベロープを持たない
    • カプシドタンパク質で、正20面体を構成
    • 感染は、受容体CD155を介する (脳のGlioma Cellに多い)
    • CD155に結合した後、エンドサイトーシスで細胞内に侵入し、細胞内でRNAが放出される
    • ウイルスRNAは、IRES(リボソーム進入領域)依存的に翻訳される
    • IRES : internal ribosome entry siteは、ポリオウイルスの740塩基あまりの5’-NCRのうち5つのstem-loop構造にまたがる400塩基程度の領域。
    • 弱毒株は、消化管では増殖し免疫誘導するが、神経毒素としては低い。その理由は、IRESの変化にあると言われている

    細胞溶解性を利用して

    脳の細胞に感染することを利用して、脳腫瘍の治療用ウイルスとして開発が行われている。

    • IRESをヒトライノウイルスに置き換えて、ポリオを起こさない組換えたポリオウイルスを作り、悪性脳腫瘍グリオブラストーマを溶解し殺す治療法の臨床試験が行われている

    悪性脳腫瘍(グリオブラストーマ)をポリオウイルスで治療する – Yahoo News, 2018/7/19, 西川伸一 | NPO法人オール・アバウト・サイエンスジャパン代表理事

    https://news.yahoo.co.jp/byline/nishikawashinichi/20180719-00089821/

    Poliovirus To Treat Brain Cancer: A Curious Chronology (2017)

    ポリオウイルスはグリア細胞のCD155抗原と親和性があり感染することができ。脳腫瘍の一種である「」の腫瘍細胞を溶解させて腫瘍の治療効果があり、臨床試験も行われている。

    https://dnascience.plos.org/2017/09/28/poliovirus-to-treat-brain-cancer-a-curious-chronology/

    ポリオウイルス – Wikipedia –

    https://ja.wikipedia.org/wiki/ポリオウイルス

    6. ポリオウイルスの標的組織特異性決定構造 – ウイルス 第54巻 第2号, pp.205-212, 2004 –

    IRESに関する記述がある。

    http://jsv.umin.jp/journal/v54-2pdf/virus54-2_205-212.pdf
    編集履歴
    2020/11/14 Mr.Harikir
  • 今日の英語 – most expensive ~ 高価であること [2020/10/14]

    今日の英語 – most expensive ~ 高価であること [2020/10/14]

    most expensive

    the most expensive model
    最も高価なモデル
    The $349 price tag (since reduced to $299) was hundreds of dollars more than the most expensive models from Amazon and Google..
    訳 : $349の表示価格は、AmazonとGoogleの最も高いモデルより更に100ドル以上(hundredsの複数形による訳)高価である。

    Apple HomePod Mini review: Remarkably big sound – Yahoo – 2020/11/12

    AppleのSmart Speakerについて、高価であることの記事より抜粋 – Harikiri(Mr)

    https://www.yahoo.com/finance/news/apple-homepod-mini-review-remarkably-140037586.html
    編集履歴
    2020/11/14 Harikiri(Mr)
  • 今日の英語 – side-by-side ~ – 横並びの意味 [2020/10/14]

    今日の英語 – side-by-side ~ – 横並びの意味 [2020/10/14]

    side-by-side

    side-by-side
    並びに、および、並行してのイメージ
    release testing and side-by-side extended characterization analysis.
    訳 : リリーステスト並びに拡張分析
  • [Bio-Equip] Cytiva – Plasmidselect Xtra [2020/11/14]  ID24783

    [Bio-Equip] Cytiva – Plasmidselect Xtra [2020/11/14] ID24783

    PlasmidSelect Xtra

    Super coilになっているplasmid DNAを精製するクロマト担体。

    Plasmidselect Xtra – Cytiva –

    製品情報

    https://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/sigma/ge28402401?lang=ja&region=JP&gclid=Cj0KCQiA-rj9BRCAARIsANB_4AA5wU8x343zgnrhseRB8TL5Yl5KKWze1xYOFQG3evkT1Y8S_fy_NL0aAsSJEALw_wcB

    Plasmidselect Xtra データシート – Cytiva –

    Scale-up of the PlasmidSelect Xtra process

    https://cytivalifesciences.co.jp/catalog/pdf/28409487.pdf
  • [健康] 睡眠時無呼吸症候群 – 対処法・体験談 [2020/11/13]

    [健康] 睡眠時無呼吸症候群 – 対処法・体験談 [2020/11/13]

    睡眠時無呼吸症候群

    まさに、睡眠時に呼吸が止まっているのですが、その結果、酸素取り込みができずに血中の酸素濃度が95%を切る状態が、何度となく生じる睡眠における症状のことです。90%を切ると重症などと言われます。詳しいことは、以下の参考文献のリンクに譲ります。

    因みに、緑内障の危険因子でもあります。

    僕の場合

    Mr. Harikiriも「睡眠時無呼吸症候群」の診断を2016年に受けました。入院により睡眠時の心電図や血中酸素濃度を測定して検査を受けたのでした。

    以前から、いびきがあり、呼吸ができず苦しくて目が覚めることが、頻繁では無いですがありました。

    検査を受ける頃は、頻繁に苦しくて目が覚めるというのを一夜で何度も起こっていました。

    CPAP治療

    検査を受けて、CPAPという装置で治療(?)を行うことになりました。それが1ヶ月も持ちませんでした。装置は、鼻と口に覆う人工呼吸器のようなもので、呼吸をサポートするらしいのですが、それがあると逆に呼吸を邪魔されて苦しくなるのでした。

    1ヶ月程度で治療(?)を中断しました。別の医者に行って、「ナステント」というシリコンチューブでできた医療機器を使うことにしました。自分で鼻から奥に装着して、鼻と口腔の境にあるべんが閉じないようにして、気道が必ずそのシリコンチューブから鼻に確保される状態を作るチューブです。これは、結構効果的でした。ただ、鼻に毎回、数百円のチューブを使い切りで装着するのは面倒であることと、コストが掛かるのがデメリットでした。

    そこで、体重を減らすことにしました。追加で横向きに寝るように毎日頑張りました。減量には、当時流行った「バターコーヒー」で食事を減らして半年で8kg程度減量することが出来ました。その頃には、いびきはするものの、睡眠時の無呼吸は、自覚症状としての苦しくて目が覚めてしまうようなことはなく、睡眠の質もだいぶ改善しました。

    それから以降は、体重が増えないようにすることと、横向きで寝ることを続けています。でも、いびきはまだしているみたいですが、自覚症状としての苦しさのあまり目が覚めることはほとんどなくなりました。

    睡眠時無呼吸症候群 – 大阪回生病院 –

    http://www.kaisei-hp.co.jp/sleep/sas/tiryo.html

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    2020/11/13, Mr. Harikiri
    2022/03/13, 追記(僕の場合)

  • [Life] お世話になった入社当時の上司が亡くなった – 自分も年齢を重ねて、しみじみ思う[2020/11/13]

    [Life] お世話になった入社当時の上司が亡くなった – 自分も年齢を重ねて、しみじみ思う[2020/11/13]

    知らない内にお別れしていたのですね

    突然の訃報で、落ち着かない自分の心を落ち着けるために、故人を思いながら、昔のことを綴ります。

    今年2020年の6/6に、HMさんが75歳で旅立たれた事をご家族から、今日お葉書をいただきました。私との年齢差は18歳でした。HMさんは、私が社会人として初めて勤めた会社の最初の上司でした。一緒に仕事をした期間は、5年程度でしたが、今の私の仕事の考え方・進め方にも大きな影響を受けていす。

    イノベイティブな方でした

    HMさんは、もう40年前ですが、バイオロジクスのプロジェクトを進めながら、精製の効率化を目的に、「自動精製装置」称した装置の開発を並行して進められていました。4℃の冷室に分画分子量の異なるホローファイバーと送液ポンプを1セットとして、ラボカートに複数台を組み合わせて載せてありました。私も、工作が好きだったので、自分の仕事の傍(かたわら)、横目でその稼働の様子を観察していました。新しいものもお好きで、パソコンも、シャープのMZ-80や東芝のパソピアなども導入して、ウイルス活性TCID50などの測定などにも活用していました。

    強い影響

    そのように、イノベイティブな方だったので、私も色々と自由に予算を使って研究をさせてもらいました。サイエンスについては、主たる仕事なので、当然自由に予算を使って研究をしていましたが、「自動精製装置」について、私も意志を継ぐ形で、独自に関わりました。まあ、今思えば遊びですね。私の場合は、自動精製装置といつても、当時Milliporeから新製品として出てきた、Pellicon Cassetteにステンレス配管、送液ポンプとインバータによる流量調整、液面センサーによる濃縮と送液のコントロール、電磁バルブによるによる洗浄ステップの自動シーケンス、などの一連の自動化したタンジェンシャルフロー・システム(TFF)の開発です。この自動精製装置に付随して、ハード面では、アナログ/デジタル変換(A/D, D/A変換)、ノイズキャンセリング技術、ソフト面では、Z80のマシン語、BACISプログラミングなども触れる機会を持つことができたのも、HMさんのお陰です。

    会うタイミングを逃してしまった

    数年前の年賀状に、「また会いませんか」と書かれていたのですが、印刷で書かれていたので、年賀状を書かれた宛先には全てに、そう書かれていたと思っていました。今、思えば、私に対して書いたものと思われてきます。そう思う理由は、その年まで、年に1回程度の連絡を取っていた事や、その年の年賀状を出した時、その返事として、返ってきた「年賀状」に書かれていたことから、私に対して書かれたと思われます。

    連絡を取らなかったことが非常に残念に思われます。当時、私も仕事にやりがいもあり、かつ、強いプレッシャーも受けていた時期でした。でも、残念で仕方ありません。

    ご冥福を!

    お別れですね。ご冥福をお祈りします。

    2020/11/13 Harikir(Mr)
  • 気になる企業 – Molecular Medicine ;MolMed – [2020/11/09]

    気になる企業 – Molecular Medicine ;MolMed – [2020/11/09]

    ID12516

    MolMed

    • イタリア
    • ウイルス・ベクターを用いた遺伝子治療薬製造のCDMO

    サービス

    • MolMed独自のテクノロジーを持っている。
    • MolMedは、ベクター製造用の独自のパッケージングプラスミドとプロデューサー細胞株(Producer Cell Line; PCL)を提供しています。
    • プロセス開発と分析メソッド開発
    • ウイルスベクター製造プロセスのプロセス最適化、スケールアップ、自動化を社内で行っています。 並行して、製品固有の分析メソッドを開発、検証、認定します。
    • GMP製造
      • 当社独自のプロセスに基づいて、RVV: retroviral vectorおよびLVV: rentiviral vector製造用に48Lおよび200Lのバッチ
      • さまざまなセルタイプのGMPマスターおよびワーキングセルバンク(MCB、WCB)も製造
      • 施設は、臨床製品と商業製品の両方の生産についてイタリアの保健当局によって承認されている
    • QCテスト
      • 安全性、効力、特性評価、純度などのベクターについて100以上の社内テストを実施可能
    • QAおよび規制サポート
      • MolMed品質管理システムは、EU ATMP GMPおよび食品医薬品局(FDA)のガイドラインに準拠
      • Pre-IND、IND、IMPD、試験固有の手順、指定申請(希少疾病用医薬品など)、販売承認申請(および同等のもの)の文書化など、国内および国際機関への科学的アドバイスに対するクライアントサポートも提供

    MolMed

    https://www.molmed.com/

    AGCが買収

    AGC、伊Molmed社を買収し遺伝子細胞治療の開発製造受託に参入へ – 日経バイオ, 2020/03/17 –

    285億円

    https://bio.nikkeibp.co.jp/atcl/news/p1/20/03/17/06701/
    編集履歴
    2020/11/09 Harikiri
  • 今日の英語 – US presidential Election ~ US大統領選挙  [2020/11/08]

    今日の英語 – US presidential Election ~ US大統領選挙 [2020/11/08]

    US presidential Election

    訳 : アメリカ大統領選挙。
    日本時間、2020/11/08、雌雄を決するとされていた「ペンシルベニア」の投票結果が、Biden氏の当選確実として、ペンシルバニアの20のElectorを獲得し、過半数の270を超え273となる見通しとなりました。その結果、現職のTrump氏からBidne氏に次期大統領が代わるとの報道が、各社大手メディから伝えられました。
    Elector : 選挙人、選挙人精度は、日本の江戸時代に導入された制度。南部では白人は少ないが、奴隷の数は多かったという事情を踏まえ、人口に応じた選挙人数が設定されます。従って、人口の多い、カリフォルニア州の選挙人数は55、テキサス州38、ニューヨーク州は29、など、大都市がある州は選挙人数は多くなっています。

    アメリカ選挙人団 – wikipedia –

    https://ja.wikipedia.org/wiki/アメリカ選挙人団
  • [Cafe] 東大阪市にある 上高地「あずさ珈琲」- 山のカフェ&レストラン 8:00~22:00 [2020/11/08]

    [Cafe] 東大阪市にある 上高地「あずさ珈琲」- 山のカフェ&レストラン 8:00~22:00 [2020/11/08]

    あずさ珈琲

    チェーン展開を進めているカフェ&レストランです。東大阪市近辺にあります。僕の一押しは、「卵かけご飯」。先日(大阪の八尾店)と今日(小坂店)で、それぞれランチとモーニングしました。いずれにも生卵(¥100)を追加して、卵かけご飯にしました。

    今日は、「信州の和定食」(¥680)のモーニングセットに生卵を付けてました。

    メインは鳥塩焼き、具沢山の「豚汁」、田楽、そして卵かけご飯。

    モーニングセット

    ランチ

    ランチにも生卵。りんご乙女は、輪切りのりんごが使われたお菓子でした。

    編集情報
    2020/11/08 Mr.HARIKIRI