カテゴリー: KNOWLEDGE

[Knowledge] ニューロンとグリア細胞 – ID12734 [2020/12/16]
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余談

アインシュタインの脳は、死後も保存されているという。研究者によれば、アインシュタインのニューロン数は、一般平均と同等であったが、脳重量は、平均より重かった。その重量差は、グリア細胞の数の多さであった。

考察するに、ニューロンを長時間活動させることに資するグア細胞(アウトロサイト)の多さが、深く思考するために必要であるのではないかと考えられる。

脳の細胞

ニューロン : グリア細胞　= 1 (>0.1兆個) : 10 (>1兆個)

ニューロン
- 神経細胞
- 信号伝達のノード
- ニューロン同士の結びつきが思考のパターン
- プログラム言語でいうと、if then文
- 大昔のコンピュータで言うと「リレー・ユニット」
- 少し前のコンピュータで言うと、「トランジスタ」
グリア細胞の種類
- 活動電位を発生しないサイレントな細胞と思われて来た
- 睡眠時に脳内から有害物質を除去している
- グリア同士のやり取り
  - ATPを使う(サイエンス2004/7月号)
- オリゴデンドロサイト
  - ミエリン鞘を作る
  - ミエリンが無いと信号伝達速度は1/100に落ちる
  - ミエリンは、神経回路の固定化
  - ヒトの神経が再生しない原因の一つ
  - 生後〜20歳ごろまでに作られる
- ミクログリア
  - 多機能細胞である(膜貫通タンパク質 TREM2/DAP12 – ITAM)
  - 神経細胞の増殖・生存、視細胞の貪食、リソソーム機能、脂質代謝のホメオスタシスなどの調整
  - 中枢神経系 (CNS)での免疫機能を担う (感染症・がんなどによる炎症や、ミエリンの代謝回転シグナルに応答する)
  - 骨髄由来の造血幹細胞が未熟な内に脳内に入ったもの
  - * TREM2 : Triggering Receptor Expressed on Myeloid cell 2
  - * DAP12 : DNAX-activating protein of 12 kDa
  - * ITAM : Immunoreceptor tyosine-based activation motif
- アストロサイト
  - グリア細胞の中で最も数が多い
  - 多数の突起を軸索に伸ばして、脳空間を埋めている
  - 栄養の運搬、過剰なイオンの吸収、損傷の修復
  - BBBを担っている
  - (星細胞と言われたりする)
- シュワン(Schwann cell, オリゴデンドロサイトと同種)
グリア細胞 – 日本生物部理学会 – より
https://www.biophys.jp/highschool/A-08.html

Recent studies utilizing human genetics, brain imaging, and single-cell RNA sequencing have substantively elucidated the biochemical and gene expression programs that support microglial responses to damage – Vigil社, 2020/12
https://www.vigilneuro.com/trem2

神経軸索ガイダンス因子
- RGM-A,B
  - Neogenin関連
- Nogo-A~C
- Netrin
  - 細胞膜
- セマフォリン
- エフリン
Blood Brain Barrier (BBB)

脳内の毛細血管の周囲には、脳内毛細血管内皮細胞を介してアストロサイトが取り巻いている。

脳内毛細血管内皮細胞は一層であり、その細胞と細胞の間を「Tight Junction」と呼び、BBBの本質である。

BBBが存在しない脳領域

全身に及ぶホルモンの分泌が必要な脳領域には、BBBは存在しない．
- 脳室周囲機関
  - 松果体・漏斗
  - 脳下垂体
  - 最後野
編集履歴
```
2020/03/29 はりきり(Mr)
2020/07/14 追記(アインシュタイン) 2020/12/16、追記 (ミクログリアが多機能である分子機構TREM2について)
```
2020年3月29日
COVID-19関連 — 体外式膜型人工肺（Extracorporeal Membrane Oxygenation：ECMO; エクモ）- ID12683 [2020/03/29]
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人工肺医療装置 – Extracorporeal membrane oxygenation（ECMO）

COVID-19の局面は，死者を如何に少なくできるかに焦点が移ってきている．アメリカのトランプ大統領は，GMに対して国防生産法に従い，「人工呼吸器」の生産を命じたと(3/28)と報道された．

人工呼吸器の使用よりも，より重症な場合に使用される「人工肺医療装置」がある．2009年の新型インフルエンザでは，既に，人工肺医療装置であるECMOの重要性が認識されているが，今回のCOVID-19においても，ECMOについてTV報道されていた．

日本には、1,300台が保有されているとのこと。

ECMOは，例に漏れず日本製ではなく，欧米の数社が製造販売している．

以下，ECMOについて，原理，構造，製造メーカーについて調査した．
```
編集履歴
2020/03/29 はりきり(Mr)
2020/04/19 Xenios AGより図を拝借
```
ECMO

原理
- 鎖骨下中心静脈や太ももの付け根の静脈から静脈血をポンプで取り出し体外循環によって，膜交換型のOxygenatorに送り，酸素と二酸化炭素を交換し，動脈に血液を戻す．
構造
- 血液ポンプは遠心ポンプ
- 従来のボールベアリング型では，回転軸部での発熱
  - 溶血や血栓形成，血液変性
  - 長期使用には向かなかった．
- 現在主流のポンプヘッド部の軸部を点で支える点支持軸受
  - 過熱を抑制し長期可能
- 膜型人工肺
  - 直径0.1 mm 程の中空糸膜によるガス交換膜
  - この中空糸膜を数千本束ねた構造
  - 接触面積は１～３m^２
  - 中空糸内部を酸素と空気の混合ガスが流れる
  - 中空糸の外側を血液が環流する
  - 血液相とガス相のガス分圧較差（圧力勾配）が生じることで，ガス交換が行われる
- 膜の素材及び構造
  - 従来は多孔質ポリプロピレン製
    疎水性と血液の表面張力により，血液の漏出を防ぐ
    長期使用では徐々に膜の疎水性が損なわれ，血漿リークが問題となっていた。
  - 近年では，ポリメチルペンテン素材
    
    非対称構造多孔質膜
    
    構造の安定化
    
    長期使用可能
送血および脱血回路
- ヘパリンコーティング
  - 血栓形成の抑制効果
  - ECMOの臨床使用成績の向上に大きく貢献
  - イオン結合法
    ヘパリンがマイナスに荷電
    基剤表面を陽イオン化処理することでヘパリンを結合させる。
    コーティング層が厚く，徐々にヘパリンが溶け出すことで強い抗血栓作用を発現
    比較的低コストで処理が可能
    結合力が弱く長期の抗血栓作用は期待できない。
  - 共有結合法
    ヘパリン分子のカルボキシル基，水酸基，アミノ基を利用して基材表面に付着させる
    結合力が強い
    長期に亘り抗血栓作用が維持
    製造コストは高い
  - その他
    
    圧モニタリング
    
    脱血圧
    
    人工肺前後圧
    
    脱血側酸素飽和度
    
    フローメータ
    
    温度センサー
適応
- 急性重症呼吸不全患者に対して，従来の人工呼吸管理では生命が維持できなくなった時点，または従来の人工呼吸管理を続けた場合に，自己肺に不可逆的な障害をこうむるおそれがある時点で適応
具体的な適応
- 重症呼吸不全 : respiratory ECMO，平均適応日数 10~14日
  - 成人の場合 : PaO2/FiO2 ratio（PFR）＜80
  - 小児の場合 : oxygenation index（OI）＞40 (参考文献2-1)
- 重症心不全 : cardiac ECMO
課題
- 多大な費用を消耗
- 多くのスタッフの労力を必要
- 日本における2009 年のH1N1 インフルエンザでは，ECMOの成績は，他の先進国と比べて劣っていた
- 専門スタッフの欠如
- 適切な機材の欠如
- 患者の集約化がなされていないこと
酸素供給量の計算
- 酸素供給量＝動脈血酸素飽和度（SaO₂） ×血中ヘモグロビン濃度(Hb)（g/dl）×10×心拍出量（L/min）×1.36
- 例
  - SaO₂ :80%, 90%, 100%
  - Hb :8g/dl, 10g/dl
ECMOプロジェクト
- 日本の ECMO 成績向上を目的として，2012 年よりが開始
- 症例登録
- 適切な ECMO 機材に関する情報提供
- 症例検討会やシミュレーションコースの開催
ECMOサプライヤー
- Medtronic
- Maquet Holding
- Sorin Group
- Xenios AG
- ALung Technologies
Xenios AG

以下の図は、Xenios AGサイトより。以上の説明より、以下の図は理解できると思います。

以上

参考文献

参考文献1

特集進化した呼吸管理 (2014) –
https://www.jrs.or.jp/quicklink/journal/nopass_pdf/ajrs/003060777j.pdf

参考文献2

Extracorporeal Life Support Organization（ELSO）
https://www.elso.org/

参考文献2-1

ELSO Guidelines
https://www.elso.org/Resources/Guidelines.aspx

参考文献3

体外式膜型人工肺（ECMO）の最近の進歩, 四国医誌７３巻５，６号２０７～２２０ DECEMBER２５，２０１７（平２９）
https://repo.lib.tokushima-u.ac.jp/files/public/11/112039/20180809152938466709/sam_73_5-6_207.pdf

Extracorporeal Membrane Oxygenation (ECMO) Systems Market 2019 to 2024 Growth Analysis by Manufacturers, Regions, Type and Application, Revenue, Market Size, Gross Margin Forecast Analysis
https://www.marketwatch.com/press-release/extracorporeal-membrane-oxygenation-ecmo-systems-market-2019-to-2024-growth-analysis-by-manufacturers-regions-type-and-application-revenue-market-size-gross-margin-forecast-analysis-2019-11-08
2020年3月29日
[Bio-Edu]腫瘍溶解性ウイルスの発見と体内における免疫系の活性化について – ID12670
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はじめに

英文の参考1(2017)を元に、周辺情報も含めてまとめました。

脳腫瘍

脳を形作る細胞 (神経組織 : Nervous tissue)
- ニューロンとグリアの比率は、1:10
- ニューロン : nerve cells (neurons)
  - 神経伝達の主役
  - 分裂しないためDNA変異の機会がなく腫瘍化しない
- グリア細胞 (glia): 星細胞 (star-shaped astocytes)
  - 増殖能を有しており、癌化すれば脳腫瘍の主役となる(gliomas)
  - 空間を作るために存在しているのみではなく、ニューロンを動かすエネルギーを供給している
  - その数は、ニューロンよりはるかに多い
  - アインシュタイの脳の大きさは有名ですが、ある研究機関の調査では、ニューロンの数は健常人と変わらないものの、グリア細胞の数が多いという調査結果を出したらと聞いたことがあります(個人的知識)
腫瘍溶解性の発見
- マンハッタンの医師ウィリアム・ゴーリー (ゴーリーの毒素: Coley’s toxins)
  - 皮膚に感染した連鎖球菌による感染症で首の腫瘍が溶けることを発見(19世紀末)
ウイルスの免疫系との接触と免疫系
1. 病原体(pathogen)は、抗原提示細胞(antigen-presenting cell : sentinel)、マクロファージ、樹状細胞(dendritic cell)に遭遇 (sentinelにも感染)
2. pathogenは、これら細胞の表面にあるtoll-like receptor (TLR)に結合(ちなみに、TLRはRNAにも結合する)、この記事では、この細胞が腫瘍細胞であることを想定している。
3. TLRは細胞内にシグナル(danger signal,etc.)を発信
4. 好中球(neutrophils)は、抗ウイルス物質(補体系のタンパク質、コレクチン、インターフェロン)を放出
5. やって来たT cell (T細胞)が、更にインターフェロンを放出する(腫瘍細胞を殺す)と共に、B cell (B細胞)を活性化
ポリオウイルスによる腫瘍攻略を試みた最初の事例

医者であるMatthias Gromeierは、再発性神経膠腫をポリ王位するで治療することを考えた。
- ポリオウイルス (改良されたSabin-Rhinovirus)ワクチン: PVSRIPO (病原性を示さないウイルス株)
- Neuronには感染しない
- 再発性神経膠腫には感染する (神経膠腫細胞には、CD155が多く発現している)
- 野生型のポリオウイルスは、霊長類の脳幹と脊髄のNeuronにのみ感染し、1~2%の確率で「弛緩性麻痺」を起こす。感染のための細胞表面の受容体(receptor)は、CD155。
特許技術へと進展

2017/08/03、Dr. Gromeierらによる「ヒト腫瘍の腫瘍溶解性ポリオウイルス」: OncPoの特許を取得、とありますが、この記事を介している今現在(2020/3)の段階で、その技術の成果がどうなっていの情報は、まだ、持っていません。今後、調査します。

参考1
Poliovirus To Treat Brain Cancer: A Curious Chronology , Ricki Lewis PhD – PROL BLOG – より
https://blogs.plos.org/dnascience/2017/09/28/poliovirus-to-treat-brain-cancer-a-curious-chronology/

以上
2020年3月28日
[健康] 風邪ウイルス (まとめ) – イラノウイルス、アデノウイルス、コロナウイルス・・・ – かぜは万病の元 – ID11306 [2020/03/03]
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かぜの症状を示すウイルス

原因ウイルス
1. ライノウイルス (rhinovirus) ¹⁾
  - 鼻風邪ウイルス
  - 風邪の30%~50%
  - 100種以上の亜群がある。
  - Picornavirus=pico[スペイン語で、小さい] rna[RNA] virus[ウイルス]）科に属する。以下はヒトに感染する
    エンテロウイルス属
    ライノウイルス属
    ヘパトウイルス属（Ａ型肝炎ウイルス。以前エンテロウイルス72型)
  - 春秋に多い
2. アデノウイルス (adenovirus) ²⁾
  - 呼吸器感染症
  - プール熱
  - 流行性結膜炎
  - 出血性膀胱炎
  - 胃腸炎
3. コロナウイルス (coronavirus) ³⁾
  - 風邪の20%程度を占める
  - 新型としてSARS, MERS, 最近では、SARS2が知られる
4. RSウイルス (RSV) ⁴⁾
  1. 気道感染症の一般的な原因で、ほぼすべての小児が4歳になるまでに感染
5. ヒトメタニューモウイルス (hMPV) ⁴⁾
  - RSウイルスに似ていますが、別のウイルスです。hMPVはRSウイルスと季節的に同じ時期に発生
  - RSウイルスほど多くの小児に感染しません。
症状
- 鼻、副鼻腔、のどの粘膜に起こるウイルス感染症 ⁵⁾
- 扁桃・咽頭炎 ⁶⁾
その他の話題

A型インフルエンザとライノウイルスの同時感染は、高い確率で起こらないことが、大規模研究の報告がなされています ⁷⁾

参考文献

1) ライノウイルスについて – 横浜市
https://www.msdmanuals.com/ja-jp/ホーム/news/external/2019/12/17/18/43/753101

2) アデノウイルス解説ページ-アデノウイルスの種類と病気
https://www.niid.go.jp/niid/ja/adeno-pfc-m/2110-idsc/4th/4326-adeno-virus-page2.html

3) コロナウイルス(投稿)

4) RSウイルス（RSV）感染症とヒトメタニューモウイルス感染症- MSDマニュアル家庭版
https://www.msdmanuals.com/ja-jp/ホーム/23-小児の健康上の問題/乳児と小児におけるウイルス感染症/rsウイルス-（rsv）-感染症とヒトメタニューモウイルス感染症

5) かぜ（感冒）- MSDマニュアル家庭版
https://www.msdmanuals.com/ja-jp/ホーム/16-感染症/ウイルス感染症/かぜ（感冒）?query=ライノウイルス

6) 扁桃・咽頭炎- MSDマニュアル家庭版
https://www.msdmanuals.com/ja-jp/ホーム/19-耳、鼻、のどの病気/口とのどの病気/扁桃・咽頭炎?query=ライノウイルス

7) 風邪とインフルエンザの同時感染がめったにない理由- MSDマニュアル家庭版
https://www.msdmanuals.com/ja-jp/ホーム/news/external/2019/12/17/18/43/753101
2020年3月3日

[健康] 新型コロナウイルス(Sars-Cov-2)、MARS/SARSとの違い – 感染力 – [2020/10/11]

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ID10959

風邪のウイルス、コロナウイルス

ヒトからヒトへ感染する風邪の原因ウイルスの10~15%は、コロナウイルス(Human Coronavirus: HCoV)といわれている。流行期には35%にも達する。

HCoV-229E (αコロナウイルスに分類)
HCoV-OC43 (βコロナウイルスに分類)
HCoV-NL63 (αコロナウイルスに分類)
HCoV-HKU1 (βコロナウイルスに分類)

動物からヒトへ感染するコロナウイルス

重症化しやすい動物からヒトへ感染するコロナウイルスは、2種類が知られていましたが、新型コロナウイルスが加わり、3種類となりました。

物性など

安定性(感染力)まとめ

皮膚表面、80%エタノールで15秒
咳による飛沫では、空気中で最長3時間
金属の銅では、4時間
皮膚での感染力維持期間は、インフルエンザウイルスの1.8時間程度と比較して、9時間
段ボールでは、最長24時間
金属・ガラス・プラスチックでは、最長9日間

新型コロナウイルスの安定性

京都府立医科大学大学院は、「SARS-CoV-2(新型コロナウイルス)とIAV(インフルエンザA型ウイルス)と細胞培養培地の混合物を様々な物体の表面上に塗布して安定性の評価結果を発表しました。SARS-CoV-2のステンレススチール・耐熱ガラス・プラスチック（ポリスチレン）の表面上での生存時間はIAVより8倍程度長いが、80%エタノールの15秒で不活化が可能」

消毒

一般論として、脂質二重膜があるウイルスは、アルコールによる消毒は非常に有効である。脂質はアルコールにより溶けるため、ウイルスの構造を破壊することができる。京都府立医科大学大学院の研究では、それを人の皮膚で実証した1)

1)

【論文掲載】ヒトの皮膚上に存在する新型コロナウイルスの生存期間を解明 2020/10 — 京都府立医科大学大学院医学研究科　消化器内科学　廣瀬亮平助教、内藤裕二准教授、伊藤義人教授、法医学　池谷博教授、感染病態学　中屋隆明教授ら研究グループ—
https://www.kpu-m.ac.jp/doc/news/2020/20201005.html

2)

【解説】新型コロナウイルス、表面でどれくらい生きられる？ 2020/03
https://www.bbc.com/japanese/51939641

コロナウイルスの物性・特徴

国立感染性研究所,「コロナウイルスとは」-より

直径約100nmの球形で、小さくない大きさである。表面には突起が見られる。形態が王冠“crown”に似ていることからギリシャ語で王冠を意味する“corona”という名前が付けられた。

ウイルス学的には、ニドウイルス目・コロナウイルス亜科・コロナウイルス科に分類される。

脂質二重膜のエンベロープの中にNucleocapsid（N）蛋白に巻きついたプラス鎖の一本鎖RNAのゲノムがあり、エンベロープ (envelope) 表面にはSpike（S）蛋白、Envelope（E）蛋白、Membrane（M）蛋白が配置されている。

スパイクタンパク質

注) Spike (スパイク)タンパク質は、受容体結合ドメイン(Receptor Binding Protein)と呼ばれる細胞表面に存在する受容体 (Receptor)に結合する。

2020/04/15のYAHOO Japan Newsの記事では、新型コロナウイルスでその変異が、早くも確認されたとあった。一般的に、1本鎖RNAは、2本鎖DNAと比較して、安定性が低く変異を起こし易いことが知られている。
2020/04/15 はりきり(Mr)
注)　2020/10現在、世界中で新型コロナウイルスのワクチンの開発が行われており、臨床試験の結果もModerna, Astrazenecaなど2、3が出てきている。日本への導入契約がなされたAstrazenecaのAdenovirus Vector Vaccineが最も開発が進んでおり、問題事象も無く抗体価も問題なく高まるとのこと。

ウイルスゲノムの大きさはRNAウイルスの中では最大サイズの30kbである。遺伝学的特徴からα、β、γ、δのグループに分類される。

以上、国立感染性研究所,「コロナウイルスとは」-より

以上、ウイルスと細菌の大きさの違い – 秋田大学　大学院医学系研究科・医学部 – より
http://www.med.akita-u.ac.jp/~doubutu/kansensho/virus17/virus2-2.html

新型コロナウイルスとSARS/MERSとの比較

	新型コロナウイルス	SARS (severe acute respiratory syndrome)	MERS (middle east respiratory syndrome coronavirus)
発生年	2019/12	2003	2012
病名	COVID-19	重症急性呼吸器症候群	中東呼吸器症候群
ウイルス種	コロナウイルス(1本鎖RNAウイルス)	コロナウイルス(1本鎖RNAウイルス)	コロナウイルス(1本鎖RNAウイルス)
分類	?	αコロナウイルス	αコロナウイルス
ウイルス名	SARS-CoV-2	SARS-CoV	MERS-CoV
感染経路	飛沫感染、濃厚接触	飛沫感染、濃厚接触	濃厚接触
潜伏期間	2-14 days	2-7 days	2-14 days
症状	発熱、咳、肺炎	高熱、肺炎、下痢	発熱、咳、肺炎、敗血症
発生場所	中国湖北省/武漢	中国関東省	アラビヤ半島諸国
死亡率	1.4-2.5%	9.5%	35%
起源	?	コウモリ?	ヒトコブラクダ
取り扱い	BLS3	BLS3	BSL3

まとめ

近年、世界的な流行を起こしたウイルスは、風邪のウイルスであるコロナウイルスでした。これまでに、SARS, MARSと世界的流行のなか、日本での影響は少なかったため、ウイルスにるパンデミックの経験としては、実質的にこのCOVID-19が初めてとなりました。SARSは、人間界から消えたと言われていますが、MARSは、小さな流行を繰り返しながら世界の何処かに存在しているようです。

今後の対策に向けて敵を知るために、COVID-19とSARS, MARSの比較をまとめました。

以上

編集履歴
2020/02/27 はりきり(Mr)
2020/05/01 文言整備
2020/05/10 追記(まとめ)
2020/08/02 追記(MARSはまだ存在している)

[健康] 風邪ウイルス (まとめ) – イラノウイルス、アデノウイルス、コロナウイルス・・・ – かぜは万病の元 – ID11306 [2020/03/03] ID11306

参考文献

DIAMOND online
日本は新型肺炎「発生早期」、SARSやMERSとの比較で考える対処法
https://diamond.jp/articles/-/229049

NIID 国立感染性研究所
SARS（重症急性呼吸器症候群）とは
https://www.niid.go.jp/niid/ja/kansennohanashi/414-sars-intro.html

海外で健康に過ごすために　厚生労働省　検疫所 FORTH
2013年05月24日更新　中東で発生している新種のコロナウイルス感染症について（更新18）
https://www.forth.go.jp/topics/2013/05241532.html

NIID 国立感染性研究所
コロナウイルスとは
https://www.niid.go.jp/niid/ja/kansennohanashi/9303-coronavirus.html

BSL : Bio Safety Level

[Bio-Edu] Bio Safety Levelとは – 遺伝子組換え実験と輸送など – カルタヘナ法に関わる – ID144 [2020/10/28] ID144

2020年2月27日

満を持して新世代PCR装置発売、コロナウイルスを15分で測定 – ジーンソック (GeneSoC) – キョーリン製薬 (PCR原理を含めたまとめ) – △ID10926
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GeneSoC
GeneSoc

遺伝子検査定量装置 GeneSocは、キョーリン製薬が販売する。
- 原理はリアルタイムPCR法による目的遺伝子の増幅
- マイクロ流路型サーマルサイクルによる増幅反応サイクルの短時間化に成功
- 測定時間は、最短5分(~15分)
- 3波調の蛍光で検出
- 右側にある4代の検出ユニット構成により最大4検体同時測定
PCRの手順
- 検体の前処理
  - 血液からウイルスのDNAを抽出。ウイルスがRNAウイルスの場合RNAを抽出 (手作業)
  - RNAの場合、逆転写酵素というもので、DNAに変換
  - DNA増幅用の酵素(耐熱性)を添加して測定用サンプルとする
- DNAの増幅(ジーンソック、その他RPC装置)
  - 2重螺旋となっているDNAを1本ずつに解く反応 (denature: 95℃)
  - 目的ウイルスの配列に相補する配列断片(primer)をウイルスDNAに結合させる反応 (annealing: 60℃)
  - primerを足がかりにウイルスDNAの複製化する反応(extension: 75℃)
  - denatureに戻る
  - 以上のサイクルを数十回と重ねてDNAを複製する
- 最大限増幅されたDNAを定量する
リアルタイムPCRの原理

改良されたリアルタイムPCRは、最終産物としてDNAを定量するのではなく、DNA増幅の1つ1つの過程でリアルタイムに増幅されたDNA量を測定するものである。

人工的にDNAを合成するために添加している原料に蛍光標識してあり、DNA合成に使用された際に蛍光を発するように設計されている。

最終産物としてのDNAの測定工程が必要でない分、判定結果までの時間が短縮化される。加えて、増幅率としてその傾きがある程度安定した時点で、早期の予測値も可能である。

今回のGeneSocでは、PCR反応そのものを短時間化した装置となっている。装置が達成する高速化の理由を考察する。

高速化できた理由

PCR反応は、denature (例えば95℃), anneal (例えば60℃)及びextension (75℃)にの3つの反応工程で構成されている。すなわち、単純に温度と維持時間の設定をシーケンシャルに変換させていくのみである。

GeneSocでのマイクロ流路型サーマルサイクルとは、何か。

因みに、「サーマルサイクル」とは、上記の温度で言えば、95℃→60℃→75℃を1サイクル又は複数サイクルを意味する。

おそらく、従来より小さな反応空間として少ない反応液量で済む「マイクロ流路」というものを開発したと考えられる。瞬時の温度調節が可能になり、反応温度設定にかかる時間の短縮化も可能となる。

具体的に検証してみる。

サーマルサイクルとして一般的な回数30サイクル、GeneSocが謳う15分で測定が完了すると過程する。

1サイクルは、0.5分となる。各温度調節工程であるdenature, annealing及び extensionに10秒ずつかかる計算となる。

測定時間が5分のケースでは、1/3の時間になるので、各温度調節工程にかかる時間は3秒ずつとなる。

参考文献

PCRを始めませんか、長崎大学医学部附属動物実験施設、大沢一貴さん
http://www.med.nagasaki-u.ac.jp/lac/PCR.html
2020年2月27日

[ナレッジ] SAP/Speed-iのワークフロー概要 [2020/02/27]

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アクション	アクション概要
申請	承認者へ申請する処理
承認	申請情報を確認して次の承認者に進める処理
引戻し	申請者自身（途中承認者含む）が、申請内容の変更等を目的に次承認者が処理する前に、申請情報を引戻して自身の申請（途中承認）を取り消す処理
差戻し	申請情報を、前承認者または申請者に差戻す処理（否認）
取止め	差戻された申請情報を破棄する処理取止め時点でワークフローが完了する
一時保存	申請前（入力途中）の入力情報を一時的に保存する処理
複写申請	繰り返し申請したい申請情報（一時保存）を元に、新たに申請情報を作成（複写）し、申請する処理入力途中の申請情報や、完了した申請情報をコピー元として、一時保存することが可能
転送	他申請者が申請する際に複写元として利用できるように、一時保存した申請情報を任意の人に転送する処理（便利機能）
代理申請	他の申請者の代理で、申請する処理
代理承認	他の承認者の代理で、承認する処理
振替	ある特定の申請情報の承認行為を、他の承認者（同等の役職）へ依頼する処理
保留	申請情報に対し、差戻しでも承認でもな

2020年2月27日

[用語] i.m. – 投与方法

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i.m. ; IM注射; 筋肉注射; intramuscular administration

ワクチンの投与でよく使われる投与方法(経路)です。

2020年2月17日
i.v. ; 静脈投与 – 投与方法

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i.v. ; iv投与; 静脈投与; intravenous administration

2020年2月17日
[用語] i.p. – 投与方法

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i.p.; ip投与; 腹腔内投与; intraperitoneal administration; i.p.

2020年2月17日

カテゴリー: KNOWLEDGE

余談

脳の細胞

ニューロン

グリア細胞の種類

Blood Brain Barrier (BBB)

BBBが存在しない脳領域

編集履歴

人工肺医療装置 – Extracorporeal membrane oxygenation（ECMO）

原理

構造

送血および脱血回路

適応

具体的な適応

課題

酸素供給量の計算

ECMOプロジェクト

ECMOサプライヤー

Xenios AG

参考文献

はじめに

脳腫瘍

脳を形作る細胞 (神経組織 : Nervous tissue)

腫瘍溶解性の発見

ウイルスの免疫系との接触と免疫系

ポリオウイルスによる腫瘍攻略を試みた最初の事例

特許技術へと進展

かぜの症状を示すウイルス

原因ウイルス

症状

その他の話題

参考文献

風邪のウイルス、コロナウイルス

動物からヒトへ感染するコロナウイルス

物性など

安定性(感染力)まとめ

消毒

1)

2)

コロナウイルスの物性・特徴

新型コロナウイルスとSARS/MERSとの比較

まとめ

参考文献

BSL : Bio Safety Level

関連記事(COVID-19,virus)

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PCRの手順

リアルタイムPCRの原理

高速化できた理由

参考文献