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  • [Trip] ロンドンの赤バスはスタイリッシュだった(2016夏) [2019/07/28]

    [Trip] ロンドンの赤バスはスタイリッシュだった(2016夏) [2019/07/28]

    ロンドンの赤バス

    ロンドンの2階建赤バス、最新モデルは、今やスーパーカーのよう僕には見えた。日本のバスとはデザイがひと味もふた味も違った。角の取れたデザインの二階建て赤バスのライトは、おそらくLEDで、LEDであることを隠さないデザインだ。カッコいい。

  • 検索[する] – いろんな検索サイト – (プロテイン、図や写真、Googleトレンド、IPアドレス) – ID23 [2021/01/26]

    検索[する] – いろんな検索サイト – (プロテイン、図や写真、Googleトレンド、IPアドレス) – ID23 [2021/01/26]

    • PDB : Protein Data Base, 3D structure of protein
    • shutterstock : 色んな図や写真
    • SlideShare : ネットでスライドをさがすのなら、スライド限定で発見できるこのサイトがお勧め
    • Googleトレンド : 時事
    • Google Ngrams :Google bookを元に、検索単語を抽出し年代別に発見頻度をグラフ表示する、わいひろ さんのblogより
    • Google Alart : キーワードを登録しておけば、gmailに連絡がくる
    • 確認くん:その使っているマシンのIPアドレスを教えてくれる

    FDA

    編集履歴

    2019/07/28 Mr. Harikiri
    2021/01/26 追記(確認くん)
  • [Synology] NASのネットワークツールからWOLを発信してと思ったが、ルーターはRT2600acなので、iPhone用のアプリDS ROUTERの wake on LAN から自宅のPC/ビデオレコーダー等を起動する [2021/06/19]

    [Synology] NASのネットワークツールからWOLを発信してと思ったが、ルーターはRT2600acなので、iPhone用のアプリDS ROUTERの wake on LAN から自宅のPC/ビデオレコーダー等を起動する [2021/06/19]

    概要

    出先から、自宅のルーターにスマホからアクセスして、ルーターが持つWOL(wakeup on LAN)の機能を使って、目的のMACアドレスのPCを起動する

    条件

    • ルーター : RT2600ac
    • ローカルネットワークにPC、その他機器
    • モバイルは、iPhone/iPadなど

    目的

    出先から以下の操作を可能にすることが目的です。

    • iPhone/iPadなどのMobile端末を使ってPCをWake Onして、PCのデータの参照
    • ビデオレコーダーに撮りためた番組を出先から見たい時に、その電源のON
    • ローカルLANにある機器の電源のON/OFF状態を知りたい時の確認

    方法

    1. Internet経由で、iPhoneのアプリからPCをWake Upする
    2. VPN経由を追加して、同様にWake Upする

    PCの設定

    出先からPCをWake Upするには、先ず、前提として、Wake Upが可能となるようPCのBIOS、ネットワークドライバを設定しておきます。その他の前提は以下の通りです。

    • DDNSによるドメイン名を持っていること
    • PCのBIOS, ネットワークドライバの設定がされていおり、ローカルでWake Upができていること
    • PCのネットワークカードの「MACアドレス」を調べておく

    iPhoneにツールをインストール

    • SynologyサイトのDS routerの説明 source
    • iOSアプリlink

    出先からのアクセス

    • DS routerを起動
    • ドメイン名を使ってログイン (2 factor認証にも対応している)
    • メニューの「Wake Up」を選択
    • 新規に追加するには、MACアドレスを登録する
    • 表示されている名前(MACアドレスも含む)をクリックして、Wake Upさせる

    ブラウザから

    ブラウザでRT2600acに接続して「ネットワークツール」を起動、Wake-on-LAN」タグを開く。

    • デバイスの選択または、MACアドレスで追加すれば、下のデバイス・リストに追加される
    編集履歴
    2019/07/28 はりきり(Mr)
    2020/04/16 大幅修正
    2020/04/24 追記 (関連記事)
    2020/06/25 文言整備
    2020/08/09 追記(DS routerのSynologyサイトのリンク、iOSアプリのリンク)
    2021/06/19,追記(Webブラウザからのコントロール、目的の追加)
  • [Synology]  NASからexFATファィルフォーマットにアクセスするにはexFAT accessをインストール [2020/04/14]

    [Synology] NASからexFATファィルフォーマットにアクセスするにはexFAT accessをインストール [2020/04/14]

    ID182

    exFAT Access

    「exFAT Access」アプリは、Linux系OSでexFAT形式のファイルフォーマットにアクセスできるようにします。

    Synology NASとWindowsとの間でファイルをUSBメモリーで共有する場合、Linux系とWindows系の間で共通にアクセスできる機能が必要です。

    そこで、Synology NASのパッケージ・リストにはexFATにアクセスするパッケージがリストされています。

    exFATファイルフォーマットは、最近のメディア事情に合わせて、長いファイル名やサイズが大きいファイルの読み書きができるフォーマットです。

    でも、exFAT Accessはフリーでないため、インストールするには、若干の費用が必要です。

    exFAT Accessパッケージの価格は、USD 3.99 (2020/01)。

    パッケージセンターからインストールしましょう。

    USB Copy

    「USB Copy」アプリは、USBメモリーをNASに挿すと自動認識してコピーを開始し、コピー後のソースファイルの削除設定も可能です。USB Copyは、パッケージセンターからインストールします。

    設定内容

    概要ページ

    タスク設定ページ

    コピー先の設定とコピー後に元ファイルを削除するように設定しました。

    起動時間ページ

    「USB/SDストレージデバイスが挿された時には、いつでもデータをコピーする」にチェックすると、自動的にコピーされるようになります。

    ファイルフィルタページ

    使用するファイルタイプを指定しておきます。

    メモリガードに撮りためたゲームの動画を定期的にNASに一時保管するために使用しています。

    まとめ

    WindowsやNintendo SwithcのSDカードをアダプターでUSB接続し、NASの指定フォルダーにファイルを一括コピーし、その後ソースファイルを消去して、SDカードをクリアにします。

    メモリーをNASのUSB端子に差し込むと、自動的に認識されコピーが開始されます。処理が完了すれば、アラームが「ピー」っと鳴り完了です。

    編集履歴

    2019/12/04 追記
    2020/03/22 文言整備、記事の内容の見直し
    2020/04/14 USB Copyの設定ページを追加
    2021/01/05 文言整備
  • [Health] リウマチ診断 – ACPA(anti-citrullinated protein/peptide antibody)- ID1114 [2025/04/14]

    [Health] リウマチ診断 – ACPA(anti-citrullinated protein/peptide antibody)- ID1114 [2025/04/14]

    はじめに

    リウマチ、特に**関節リウマチ(Rheumatoid Arthritis, RA)**の診断は、臨床症状、画像所見、血液検査を総合的に判断して行われます。その中でも、**抗CCP抗体(anti-CCP antibody)**は非常に重要なバイオマーカーの一つです。


    ✅ 関節リウマチ(RA)の診断概要

    1. 主な診断基準(2010 ACR/EULAR)

    ACR(American College of Rheumatology)とEULAR(European League Against Rheumatism)による分類基準では、以下の項目をスコア化し、6点以上でRAと分類されます。

    分類項目内容最大点
    ① 関節の罹患数小関節の数に応じて点数が増加5点
    ② 血清学的検査RFまたは抗CCP抗体の陽性度合い3点
    ③ 急性期反応CRPまたはESRの上昇1点
    ④ 症状持続期間6週間以上持続1点

    ✅ CCP抗体(Anti-Cyclic Citrullinated Peptide Antibody)

    1. CCP抗体とは?

    • 抗CCP抗体は、環状シトルリン化ペプチドに対する自己抗体です。
    • 関節リウマチに特異的に認められる抗体の一つで、RA患者の**約70〜80%**で陽性となります。

    2. シトルリン化とは?

    • アルギニンシトルリンに変化する酵素反応(PAD酵素による脱イミノ化反応)によって生成。
    • これにより生じた変性タンパク質が免疫系によって異物と認識され、自己抗体が産生されると考えられています。

    3. CCP抗体の診断的意義

    項目CCP抗体の特徴
    感度約67〜80%(RAの患者のうち、陽性になる割合)
    特異度約95〜98%(RA以外の患者で陰性となる割合)
    診断上の意義RF(リウマトイド因子)よりも特異度が高く、RA診断において非常に有用
    発症前診断症状発現の数年前から陽性になることもあり、予測因子となりうる
    重症度予測CCP抗体陽性は進行性・重症化しやすいRAの指標とされる

    ✅ CCP抗体と他のバイオマーカーとの比較

    指標抗CCP抗体RF(リウマトイド因子)CRP / ESR(炎症マーカー)
    感度△(中〜高)◎(高い)◎(高い)
    特異度◎(非常に高い)△(中程度)×(非特異的)
    初期診断◎(非常に有用)
    進行予測◎(陽性で進行しやすい)×

    ✅ CCP抗体検査の活用のポイント

    1. RFと併用で診断感度が向上
    2. 関節炎が1〜2関節にしか現れていなくても陽性ならRAの前兆として重要視
    3. 関節破壊のリスク評価にも用いられる
    4. RA疑いの鑑別診断において、他疾患(SLEや感染性関節炎など)との区別にも有用

    ✅ まとめ

    • 抗CCP抗体は関節リウマチの診断・予後評価において最も特異性の高いバイオマーカーの一つです。
    • 症状出現前に陽性になることもあり、早期診断や治療開始の判断材料として非常に重要です。
    • RFやCRPと併用することで、より精度の高い診断が可能となります。

    編集履歴

    2019/07/28 Mrはりきり
    2025/04/14 更新(with ChatGPT)

  • [GT] 現在の遺伝子治療の技術は目標半ば – その先の遺伝子治療技術 – ID1108 [2019/07/25]と[2025/04/14]の比較

    [GT] 現在の遺伝子治療の技術は目標半ば – その先の遺伝子治療技術 – ID1108 [2019/07/25]と[2025/04/14]の比較

    2025/04での遺伝子治療は

    以下,AIに聞いてみた.末尾には私が2019年に調査したつたない記録も残している.

    歴史は結構長い.現在の遺伝子治療(Gene Therapy)は、過去数十年にわたる研究と技術の進歩により、実用的な治療手段として定着しつつあります。特に希少遺伝性疾患、血液疾患、癌、眼疾患などを対象とした治療法が登場しています。

    遺伝子治療の技術分類と製品化状況(2025年時点)

    技術分類主な技術概要特徴製品化状況
    ① 遺伝子導入AAV, レトロウイルス等欠損・変異した遺伝子をベクターで補完最も標準的・古典的手法✔ 製品化済(Zolgensma, Luxturna)
    ② RNA編集ADAR利用, LEAPER等mRNA塩基を編集し機能修復可逆的、DNA非改変× 臨床試験段階(ALS等)
    ③ ゲノム編集CRISPR, TALEN, ZFNDNA塩基を恒久的に修正正確性・倫理的課題あり× 一部臨床試験中(治験段階)
    ④ エピゲノム編集dCas9-fusion 等発現制御因子の誘導で遺伝子のON/OFFDNA改変せず柔軟な制御× 基礎研究段階
    ⑤ アンチセンス療法(ASO)antisense oligomRNA結合で翻訳阻害やスプライス制御高特異性、可逆的✔ 製品化済(Spinraza, Exondys 51)
    ⑥ RNA干渉(RNAi)siRNA, shRNA等mRNAを分解・翻訳抑制肝疾患で適用進む✔ 製品化済(Onpattro, Givlaari)
    ⑦ スプライス調整Exon skippingなどmRNAのスプライシング制御で修復筋ジス治療などに有用✔ 製品化済(Exondys 51)
    ⑧ mRNA治療合成mRNA外来mRNAから目的タンパク質を一時発現非永続的、安全性高✔ 製品化済(COVID-19ワクチン等)
    ⑨ 遺伝子サイレンシングsiRNA/ASO等と重複有害遺伝子の発現を抑制主に神経・がん領域で研究✔ 一部製品化(RNAi薬と重複)

    以上,製品化されている遺伝子治療法は,(1)遺伝子導入,(5)アンチセンス療法,(6)RNA干渉,(7)スプライシング調整,(8)mRNA治療,(9)遺伝子サイレンシングの6つである.


    ✅ 遺伝子治療とは

    遺伝子治療とは:

    体細胞のDNAに介入し、疾患の原因となる遺伝子異常を修復・置換・無効化・導入することで治療効果を得る治療法


    ✅ 遺伝子治療の種類

    分類内容
    体細胞遺伝子治療非生殖細胞に対して行う→ ヒトへの臨床応用はすべてこれ
    生殖細胞遺伝子治療精子や卵子に対する治療(遺伝する)倫理的問題のため禁止

    また、導入方法でも分類されます:

    A. in vivo法(体内直接投与)

    • 遺伝子治療薬を直接体内に投与
    • 例:Luxturna®(網膜に直接注入)

    B. ex vivo法(体外で遺伝子導入後、戻す)

    • 細胞を採取 → 遺伝子導入 → 体内に戻す
    • 例:CAR-T療法(がん免疫療法)

    ✅ ベクター(遺伝子導入手段)の種類

    ベクター特徴使用例
    AAV(アデノ随伴ウイルス)安全性高い、非増殖性、免疫反応少Luxturna, Zolgensma
    レトロウイルス / レンチウイルスゲノム組込み可能、ex vivo向きCAR-T, 血液疾患治療
    アデノウイルス高発現、免疫原性強い一部の癌治療
    非ウイルス系(リポソーム・ナノ粒子等)安全性高いが効率はやや低基礎研究やmRNAワクチン

    ✅ 現在の遺伝子治療薬(承認例)

    製品名適応疾患承認国ベクター特記事項
    Zolgensma®脊髄性筋萎縮症(SMA)米国, 日本, EUAAV9一回投与で根治の可能性
    Luxturna®遺伝性網膜ジストロフィー米国, 日本, EUAAV2眼内直接注入
    CAR-T(例:Kymriah®, Yescarta®)血液がん(B-ALL、DLBCL等)多国レンチウイルスex vivoでT細胞改変
    Roctavian®血友病AEU(2022承認)AAV5持続的なFVIII産生

    ✅ 現在の適応疾患と拡大領域

    分野治療対象例コメント
    希少遺伝性疾患SMA, 網膜疾患, 代謝異常症小児科での応用が進む
    血液疾患βサラセミア、鎌状赤血球症ex vivoで治療成功例多数
    癌(特に血液がん)CAR-T療法多数の新製品が上市
    神経疾患パーキンソン病, ALS(試験段階)血液脳関門が課題
    感染症HIVへの治療研究あり抑制より「根絶」目的の開発

    ✅ 日本における状況(2025年時点)

    • 承認済み:Zolgensma®(ノバルティス), Luxturna®(Spark)
    • CAR-T療法(Kymriah, Yescartaなど)も承認・保険適用
    • PMDAでは「再生医療等製品」として特別承認制度を用意

    ✅ 主な課題

    項目説明
    高コスト1回投与で数千万円(例:Zolgensmaは2億円超)
    免疫反応AAVなどに対する抗体があると無効化される可能性
    長期安全性発がん性や遺伝子挿入位置の影響など、長期データ不足
    製造の難しさ高度なバイオ製造施設が必要(GMP管理含む)
    倫理問題生殖細胞や遺伝的強化への応用は議論の的

    ✅ まとめ図(簡略)

    [ 遺伝子治療 ]

    ┌─────────────┬─────────────┐
    │ in vivo法 │ ex vivo法 │
    │ (AAV,直接注入) │ (細胞回収→導入→戻す) │
    └─────────────┴─────────────┘

    [ 治療対象 ]
    → 希少疾患、癌、血液疾患、眼疾患 など

    ご希望あれば…

    • 個別の治療法(Zolgensmaの作用機序など)
    • GMPと遺伝子治療の関係(製造・品質管理)
    • ICHガイドライン(例:ICH Q5A, Q5D)
    • 日本での再生医療等製品承認制度の解説

    なども詳しく解説できます。ご希望の観点があれば教えてください。


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    ChatGPT:

    検索中にエラーが発生しました

    現在の遺伝子治療薬における承認当初の薬価現在の薬価の比較について、下記に該当する代表的な製品の情報を調査・整理しました(可能な限り日本国内薬価に基づく)。


    ✅ 主な遺伝子治療薬の薬価比較(日本国内)

    製品名(一般名)適応症承認年(日本)承認当初の薬価(円)現在の薬価(円, 最新)備考
    Zolgensma®
    (オナセムノゲン アベパルボベク)
    脊髄性筋萎縮症(SMA)2020年約167,077,222円
    (1瓶)
    変動なし(2025年4月時点)単回投与・世界最高水準の薬価
    Luxturna®
    (ボレオチゲン ネパルボベク)
    遺伝性網膜ジストロフィー2021年約94,580,727円
    (両眼分)
    変動なし両眼に投与されるケースが多い
    Kymriah®
    (チサゲンレクルユーセル)
    B-ALL/DLBCL2019年約33,493,407円約31,953,000円(微減)CAR-T製剤、特定細胞加工施設要
    Yescarta®
    (アキシカブタゲン シロルユーセル)
    DLBCLなど2021年約34,210,204円約32,610,000円(微減)CAR-T製剤として第2弾

    ※薬価は1回投与分または1製品あたりの定価ベースであり、保険点数からの換算に基づく。最新薬価は厚労省の薬価基準収載表や企業開示情報から。


    ✅ 解説ポイント

    • Zolgensma
      • 2020年に薬価収載、世界最高水準の薬価
      • 2023年薬価改定でも維持。効果・費用比の評価が高い。
    • Luxturna
      • 両眼治療が基本。高額ながら希少疾患枠で評価され、薬価維持。
    • CAR-T療法(Kymriah, Yescarta)
      • いずれもわずかに薬価改定で減額された(2022~2024年にかけて)。
      • 費用効果と製造コストから、一定の薬価調整がなされた。

    ✅ 今後の見通し

    • 多くの遺伝子治療薬は単回投与かつ根治可能性があるため、薬価は高く設定されやすい。
    • 薬価維持には長期的な有効性・安全性データが必要。
    • 新たな治療薬が登場することで、今後価格競争や薬価引き下げの動きが強まる可能性あり。

    必要であれば、以下の内容も追記可能です:

    • 欧米での薬価(例:米国CMS価格、欧州保険償還額)
    • 薬価算定根拠(費用対効果評価の有無、原価方式など)
    • 日本での再生医療等製品の薬価設定制度の詳細

    ご希望があればお知らせください。


    三つの遺伝子治療の現状

    以下の三つの遺伝子治療の現状を教えて 1. 遺伝子導入による治療 2. RNA編集による治療 3. ゲノム編集による治療

    ChatGPT:

    以下に、現在の遺伝子治療の主要な3つの手法について、それぞれの現状をまとめました。


    1. 遺伝子導入による治療(Gene Addition Therapy)

    概要:
    欠損または異常な遺伝子の機能を補うため、正常な遺伝子を体細胞に導入する手法です。​

    現状:
    この手法は最も実用化が進んでおり、以下のような治療薬が承認されています。​

    • Zolgensma®(脊髄性筋萎縮症)
    • Luxturna®(遺伝性網膜ジストロフィー)
    • CAR-T療法(血液がん)

    これらの治療法は、単回投与で長期的な効果が期待される点が特徴です。​

    課題:


    2. RNA編集による治療(RNA Editing Therapy)

    概要:
    RNA編集は、DNAを改変せずにmRNAの特定の塩基を変更することで、タンパク質の機能を一時的に修正する技術です。​東京大学+1日本生物工学会+1

    現状:

    • 日本では、2022年3月より、自治医科大学附属病院と遺伝子治療研究所の共同により、ADAR2発現AAVベクター髄腔内投与による孤発性筋萎縮性側索硬化症(ALS)の第I/II相臨床試験が開始されました。 ​首相官邸ホームページ+1首相官邸ホームページ+1
    • 海外では、LEAPER(Leveraging Endogenous ADAR for Programmable Editing of RNA)などの技術が開発されており、遺伝性疾患やがんに対する応用が期待されています。​Wikipedia

    課題:


    3. ゲノム編集による治療(Genome Editing Therapy)

    概要:
    CRISPR/Cas9などの技術を用いて、DNAの特定の配列を直接修正する手法です。​

    現状:

    • 研究段階では、CRISPR/Cas9を用いたゲノム編集技術が急速に進歩しており、オフターゲット作用を低減しつつ、オンターゲットでの編集効率を上昇させた技術が日々確立されています。 ​jmsf.or.jp
    • 臨床応用に向けた研究が進められており、特に遺伝性疾患やがんに対する治療法の開発が期待されています。​

    課題:

    • オフターゲット効果の最小化​crisp_bio
    • 倫理的・法的な問題(特に生殖細胞への応用)​
    • 長期的な安全性と有効性の評価​

    薬価

    発売当初の薬価と現在の薬価を下表に示した.使用実績が少ないこともあり,薬価は維持されている.

    主な遺伝子治療薬の薬価比較(日本国内)

    製品名(一般名)適応症承認年(日本)承認当初の薬価(円)現在の薬価(円, 最新)備考
    Zolgensma®
    (オナセムノゲン アベパルボベク)
    脊髄性筋萎縮症(SMA)2020年約167,077,222円
    (1瓶)
    変動なし(2025年4月時点)単回投与・世界最高水準の薬価
    Luxturna®
    (ボレオチゲン ネパルボベク)
    遺伝性網膜ジストロフィー2021年約94,580,727円
    (両眼分)
    変動なし両眼に投与されるケースが多い
    Kymriah®
    (チサゲンレクルユーセル)
    B-ALL/DLBCL2019年約33,493,407円約31,953,000円(微減)CAR-T製剤、特定細胞加工施設要
    Yescarta®
    (アキシカブタゲン シロルユーセル)
    DLBCLなど2021年約34,210,204円約32,610,000円(微減)CAR-T製剤として第2弾

    ※薬価は1回投与分または1製品あたりの定価ベースであり、保険点数からの換算に基づく。最新薬価は厚労省の薬価基準収載表や企業開示情報から。


    遺伝子治療 (2019/7/25時点でまとめたもの)

    1. 遺伝子導入による治療

    正常な遺伝子をある細胞に補充して、正常な遺伝子によるタンパク質を体内で作らせることによる半永久的な治療法

    2. RNA編集による治療

    ゲノムから翻訳されたRNA段階での異常遺伝子を正常遺伝子に、そのRNAの寿命の期間一時的に正常にする治療法

    3. ゲノム編集による治療

    異常遺伝子を正常遺伝子に修正することで、これまでは異常な遺伝子による以上なタンパク質が作られていたものを正常な遺伝子による正常なタンパク質を作らせる治療法

    表1. 遺伝子治療技術の比較
    治療期待課題
    遺伝子治療安全性が高まってきた異常遺伝子は残る。正常遺伝子が組み込まれてる位置は制御できず、がん化の可能性がある。導入遺伝子の発現調節は困難。
    RNA編集
    ゲノム編集安全な位置への遺伝子導入が可能。異常遺伝子の機能消失が可能。プロモーターなどによる遺伝子の発現調節が可能
     
    目的外の編集の可能性。騒動組換えの効率が低く、細胞選別が

    参考文献

    http://www.nihs.go.jp/mtgt/section-1/related%20materials/201606.pdf

    編集履歴

    2019/07/25 Mrはりきり
    2025/04/14 更新(with AI)

  • [健康] 神経疾患(ミオパシー、てんかん)に共通する異常なリピート配列の発見 – リピート配列は開始コドンがなくてもたんぱく翻訳される – ID1093 [2020/07/11]

    [健康] 神経疾患(ミオパシー、てんかん)に共通する異常なリピート配列の発見 – リピート配列は開始コドンがなくてもたんぱく翻訳される – ID1093 [2020/07/11]

    はじめに

    2019/07, 東大、3つの神経筋疾患に共通する異常なリピート配列を発見、創薬応用へ

    東大は、3つの神経疾患について、異常なリピート配列を発見した。

    異常なリピートは、非翻訳領域にCGGの3塩基からなる繰り返し配列の異常伸長であり、以下に示した3つの疾患に共通しており、別の疾患と考えられてきたこれらの疾患は、共通の繰り返し配列のリピートを原因とする疾患であることがわかった。

    • 神経核内封入体病(neuronal intranuclear inclusion disease:NIID)
      • 認知症などで知られている神経変性疾患。幼少期から高齢まで幅広く発症。
      • NBPF19 遺伝子の5’非翻訳領域に存在するCGG繰り返し配列の異常伸長を確認
    • 白質脳症を伴う眼咽頭型ミオパチー(oculopharyngeal myopathy with leukoencephalopathy:OPML)
      • 頭部MRI画像で神経核内封入体病に類似した大脳白質の異常を示し、加えて眼球の運動を司る筋肉、嚥下・発声を担う咽頭の筋肉、四肢の筋肉を侵す疾患
      • 解析の結果、LOC642361・NUTM2B-AS1という別の遺伝子に、同じCGG繰り返し配列の異常伸長が存在することを確認
    • 眼咽頭遠位型ミオパチー(oculopharyngodistal myopathy:OPDM)という3つの神経筋疾患
      • 眼球運動、咽頭、さらに四肢の遠位部の筋力低下が特徴的な筋疾患で、国が定める指定難病の一つである、遠位型ミオパチーに含まれる疾患
      • 前述の白質脳症を伴う眼咽頭型ミオパチーと筋の罹患部位の分布が非常に類似していることをヒントに解析した結果、LRP12遺伝子に、やはりCGG繰り返し配列の異常伸長変異が存在することを確認

    東大、3つの神経筋疾患に共通する異常なリピート配列を発見、創薬応用へ、日経バイテク, 2019/07

    https://bio.nikkeibp.co.jp/atcl/news/p1/19/07/22/05843/

    これまでに得られている関連情報

    一般的にタンパク質への翻訳は,開始コドン(ATG)から始まる.しかし,特定の塩基配列の非常に長い繰り返し配列(リピート配列)が存在すると,開始コドンがなくても翻訳が生じることが2010年に実験的に確かめられ,repeat-associated non-ATG(RAN)翻訳と呼ばれるようになった.

    RNA翻訳, 2015, – 薬学用語解説-

    https://www.pharm.or.jp/dictionary/wiki.cgi?RAN翻訳

    「てんかんの新しい発症機構の解明 ―繰り返し配列の異常伸長によっててんかんが生じることを発見―」

    発表ポイント

    • 本邦に多く見られる、家族性のてんかんについて、次世代シーケンサーを駆使したゲノム解析によりその原因遺伝子として 3 遺伝子を発見
    • 発見した 3 つの遺伝子(SAMD12 遺伝子、TNRC6A 遺伝子、RAPGEF2 遺伝子)は、いずれの場合も、イントロン領域に存在する、TTTCA という繰り返し配列の異常伸長が、発症原因となっていることを解明
    • TTTCA 繰り返し配列の異常伸長が共通していることから、この異常伸長が直接てんかん発症の原因になっていると考えらる。神経細胞核内に TTTCA 繰り返し配列を有す る RNA の凝集体が観察され神経細胞の傷害に関与していると考えられます

    【記者会見】別々の3疾患に共通する原因がヒトゲノムCGG塩基の繰り返し配列の異常伸長であることを解明, 2019/07

    https://www.h.u-tokyo.ac.jp/press/20190723.html

    AIにこの表題について解説してもらった

    神経疾患(ミオパシー、てんかん)に共通する異常なリピート配列の発見 – リピート配列は開始コドンがなくてもたんぱく翻訳される」・・・に関して解説して

    ChatGPT:

    リピート配列と神経疾患について解説

    以下に、神経疾患における異常なリピート配列の発見と、それが開始コドンなしでタンパク翻訳される現象について、以下の観点から詳しく解説します。


    1. 異常リピート配列と神経疾患の関連性

    異常リピート配列とは
    DNAやRNA中に存在する繰り返し配列(リピート配列)が、通常の繰り返し回数を超えて異常に伸長してしまうことがあります。こうした配列の伸長は、転写されたRNAや翻訳産物(タンパク質)に異常をもたらし、神経細胞など特定の細胞で機能障害を引き起こすことが知られています。これらの異常なリピート配列は、ミオパシー(筋疾患)や一部のてんかん症例を含む神経疾患に共通して見出される例もあり、病態発生の一因と考えられています。

    疾患への影響
    ・リピート配列の伸長は、RNAの二次構造(例:ヘアピン構造)の形成を促進し、これが細胞内でのRNAの正常なスプライシングや輸送、局在に影響を与える可能性があります。
    ・また、伸長したリピートRNA自身が、細胞内のタンパク質と異常な相互作用を起こし、RNAの毒性(RNA毒性)として神経細胞にダメージを与えることも報告されています。
    ・これまでの研究では、リピート伸長疾患では、異常タンパク質の蓄積や細胞内凝集体の形成が細胞機能障害に寄与していることが示されています。


    2. 開始コドンを必要としない翻訳:RAN翻訳

    通常の翻訳開始メカニズム
    通常、mRNAからタンパク質が合成される際は、リボソームがmRNA上の最初のAUG(メチオニンをコードする開始コドン)を認識し、そこで翻訳が開始されます。このプロセスにより、正確なタンパク質配列が生産されるのが一般的です。

    RAN翻訳(Repeat-Associated Non-AUG Translation)の概要
    近年の研究により、異常に伸長したリピート配列が、従来のAUG開始コドンなしでもタンパク質翻訳を引き起こす現象が明らかになりました。これが「RAN翻訳」と呼ばれる現象です。主な特徴は以下の通りです。

    • 非典型的な翻訳開始
      リピート配列は、AUGなどの定型的な開始コドンがなくても、リボソームによって認識され翻訳が開始される可能性があります。これには、リピート配列特有の安定した二次構造(ヘアピン構造など)が関与しており、リボソームがこれらの構造を足掛かりとして翻訳開始部位を決定するという仮説が提唱されています。
    • 多様な枠(フレーム)での翻訳
      通常、リボソームがAUGを基点として翻訳すると読枠が決まりますが、RAN翻訳では、異なる3つの読枠で翻訳が行われ、複数の異なるタンパク質(またはペプチド)が産生される可能性があります。このことは、同じリピート配列由来でありながら、病態に対して多角的な影響を与えることも意味します。
    • 疾患関連性
      RAN翻訳により産生されるタンパク質やペプチドは、しばしば凝集しやすく細胞内で毒性を示すことがわかっています。たとえば、ALS(筋萎縮性側索硬化症)や前頭側頭型認知症(FTD)においても、C9ORF72遺伝子内のG4C2繰り返し配列がRAN翻訳を引き起こすことが示されており、これが神経変性の一因であると考えられています。今回取り上げたミオパシーやてんかんの場合も同様の機序が働いている可能性が指摘されます。

    3. RAN翻訳がもたらす生物学的および病理学的意義

    細胞内タンパク質の異常蓄積
    RAN翻訳により産生されるタンパク質は、通常のタンパク質とは異なり、機能を持たない場合が多い上、細胞内で凝集しやすい性質を持っています。この異常なタンパク質の蓄積は、細胞のプロテオスタシス(タンパク質の品質管理機構)を乱し、細胞死(アポトーシスやネクローシス)に繋がる可能性があります。

    新たな治療標的への展開
    RAN翻訳は、従来のRNA毒性説やタンパク質凝集仮説だけでは説明できない神経疾患の発症メカニズムの一端として注目されています。これにより、RAN翻訳自体を抑制する、または異常タンパク質のクリアランスを促進する治療法の開発が期待されています。
    また、開始コドン以外での翻訳開始という意外性は、細胞内の翻訳制御における新たな規制機構やシグナル伝達系の解明へも寄与する可能性があります。


    4. 現在の研究動向と今後の課題

    研究の進展
    近年、多くの研究グループがRAN翻訳を詳細に調べるために、細胞実験や動物モデルを用いた解析を進めています。これにより、リピート配列の二次構造と翻訳開始の関係、さらに翻訳産物の細胞内におけるふるまいや毒性メカニズムが徐々に解明されつつあります。

    今後の課題

    • メカニズムのさらなる解明
      どのような分子メカニズムや細胞内環境条件がRAN翻訳を促進するのか、または抑制するのか、詳細な研究が必要です。
    • 治療法の開発
      RAN翻訳による毒性タンパク質の産生を抑制するための分子標的や、異常タンパク質の除去メカニズムについて、臨床応用を見据えた研究が進められる必要があります。
    • 診断法との関連
      異常なリピート配列およびその翻訳産物がバイオマーカーとして用いられ、早期診断や病状の進行モニタリングに役立つ可能性も模索されています。

    総括

    異常なリピート配列の発見および、開始コドンがなくても行われるRAN翻訳は、神経疾患(ミオパシー、てんかんなど)における新たな病因解明の一端となっています。従来のタンパク質翻訳の常識に挑戦するこの現象は、細胞内で異常タンパク質が産生されることで神経細胞の機能障害や死に至るメカニズムの一部を説明し、また新たな治療標的としても注目されています。これからの研究の進展により、より具体的な治療戦略や診断技術の確立につながることが期待されます。

    観想(2020/07/11)

    mRNAからタンパク質に翻訳している機関はRibosomeであるが、Ribosomeがエラーしていると考えられるのか疑問に残った。Ribosome自体の頑健性に関わっている可能性があるもあるかもしれない。

    この疑問にAIが答えた(2025/04/14)

    mRNAからタンパク質に翻訳している機関はRibosomeであるが、Ribosomeがエラーしていると考えられるのか疑問に残った。どう解釈されているのか?

    ChatGPT:

    とても本質的なご質問です。
    RAN翻訳(Repeat-Associated Non-AUG Translation)では、確かに通常のAUGによる開始ルールを無視してタンパク質が産生されるため、「リボソームがエラーを起こしているのか?」という疑問が生じるのは自然なことです。

    この現象について、現時点での研究者の解釈分子メカニズム仮説を以下のように整理して解説します。


    ❶ リボソームの「エラー」ではないという見解

    ▶ 基本的立場:

    **RAN翻訳は「エラー」ではなく、ある種の「非正統的な翻訳開始メカニズム」**と考えられています。
    つまり、リボソームが暴走しているわけではなく、「異常なRNA構造や細胞環境の条件下で、意図せず自然に起こる代替的な翻訳開始様式」であるというのが主流の見解です。


    ❷ RAN翻訳の機構に関する現在の理解

    1. RNA構造の影響

    異常に伸長したリピート配列(例:G4C2, CAGなど)は、

    • G-quadruplex構造
    • ヘアピン/ステムループ構造

    などの強い二次構造をとることがあります。

    🔸これにより、リボソームがmRNA上で異常な停滞・スキャニングをするようになり、
    本来のAUGコドン以外の部位で翻訳を開始してしまうのではないかと考えられています。


    2. リボソームのキャップ依存/非依存的開始

    通常、翻訳開始は次の順に進みます:

    1. mRNAの5’末端のキャップ構造をリボソームが認識
    2. AUG開始コドンまでスキャン
    3. AUGで開始

    一方、RAN翻訳では:

    • キャップ依存性が弱くなるまたは不要
    • 開始コドンがなくても、繰り返し配列内から翻訳が始まる

    このことから、「リボソームが異常な構造を誤ってAUGと誤認する」「翻訳開始因子の異常利用」などのメカニズムが疑われています。


    3. 翻訳開始因子の関与も一部で示唆

    研究により、以下のような非正統的翻訳を助けるタンパク質の関与も示唆されています:

    • eIF2A(通常と異なる翻訳開始を担う因子)
    • eIF4G, eIF4Aなどのキャップ依存経路以外を使う因子

    つまり、リボソーム単独の異常ではなく、翻訳の「開始ルール」を逸脱するような、RNA構造や翻訳補助因子の複合的な異常利用が関係していると考えられています。


    ❸ 現時点の仮説まとめ

    項目RAN翻訳の仮説的解釈
    ❓ リボソームのエラーか?✕ エラーではなく、「非正統的な機構」
    💡 開始のきっかけRNAの異常な二次構造が誘引
    🔧 翻訳因子の関与eIF2Aやその他補助因子がAUGなし翻訳を許容する可能性
    🎯 結果本来の目的と異なる翻訳が起こり、毒性タンパク質が生じる

    ❹ 今後の研究課題

    • なぜリボソームが繰り返し配列を開始点と誤認するのか?
    • どの翻訳開始因子が関与しているのか?
    • 正常細胞でもRAN翻訳が起きるか?
    • RAN翻訳の抑制が治療に繋がるか?

    これらは現在も活発に研究が進められているテーマです。


    ✅ 結論

    RAN翻訳は、リボソームのエラーではなく、リピート配列の異常構造や特異的な翻訳因子の関与によって引き起こされる、特殊な翻訳開始現象と理解されています。
    リボソームは依然として「正確に動作」しているが、その起動のきっかけが異常な形で与えられている、というイメージが妥当です。

    編集履歴

    2020/07/11 Mr.はりきり
    2025/04/14 追記(with ChatGPT)

  • [Synology] NASの追加メモリ – WD Black SSD 製品の故障対応はこんな感じでした [2019/07/26]

    [Synology] NASの追加メモリ – WD Black SSD 製品の故障対応はこんな感じでした [2019/07/26]

    ID1089

    はじめに

    DS918+にSSD cacheを2枚挿してRAID5の速度の効率化を測っていたが、ある時、1枚のSSDにエラーがあるとアラートが出ていた。Western Digital (WD)のサービスに電話連絡して説明して、交換してもらえることになった。

    今回のWDのサービスについて、その内容をここに残しておく。

    WDのサービスにコンタクトする

    ネットで検索して見つけたフリーダイアルに電話をして「NASに2枚挿ししていて、そのうち1枚についてNASから故障のエラーメッセージが出た」と伝えたところ、故障であることは間違いないので、5年保証は受けられるとのこと。製品の返品方法をメールで送ってくれた。

    送付先住所とそこを経由してマレーシアのセンターに送られるとの情報

    • トラッキング番号

    故障品を送る場合の梱包などについての注意事項

    SSDの返品

    SSD購入時のプラ容器に入れて、100円ショップで購入したCD保護用封筒に入れ、封書の裏表に適当に3ヶ所へトラッキング番号を記入してコンビニから東京の指定された三菱倉庫に送った1000円)。

    • CD保護用封筒 (100均)

    トラッキングの知らせ

    送付後、①返品製品の受領についてと、②代替の製品出荷についての2回のお知らせメールが届いた。

    • 返品製品の受領連絡
    • 代替品の出荷連絡

    到着

    ②の代替の製品出荷のメール連絡が届いてから数日、送ってから10日間程度で代替品が届いた。新品ではないようだが、使えればそれでよし。

    SSD交換は、以下のリンクをご参照ください。

    [Synology] NAS DS918+のcacheとして挿していた2枚のWestern Digital (WD)製SSDの内、1枚が不調になったので交換

    編集履歴
    2020/04/24 文言整備
    2020/07/26 文言整備
  • [ホテル] ザ リッツ・カールトン大阪でクラブラウンジを楽しむ – 本場イギリスを味わえるアフタヌンティー [2019/07/21]

    [ホテル] ザ リッツ・カールトン大阪でクラブラウンジを楽しむ – 本場イギリスを味わえるアフタヌンティー [2019/07/21]

    The Ritz-Carlton Osak

    大阪にある高級ホテルとしては、リッツカールトンは1位、2位の有名ホテルです。建設から20年以上経過していますが、デザインが古式英国様式であるため、現在でも古さや陳腐化を感じさせず、私たちを迎えてくれます。何か大事な記念日などには、ゆっくりと宿泊して日常とは違う時を過ごしたいホテルです。

    チェックイン

    The Ritz-Carlton Osakaは、大阪駅の西に位置する縦に細長いホテルです。一階にロビーがあり一般客はここでチェックイン手続きを行います。

    一休.comのプラン(Stay at Ritz-Carlton クラブフロア)では、以下のようなプランになっている。

    チェックインは15:00からなので、15:00にチェックインすれば、アフタヌーンティーを頂けます。

    一泊プランなら翌日の11:00までがチェックアウトになるので、11:00までにチェックアウトを済ませれば、そのまま、お昼の軽食を頂き、ホテルを後にすることになります。

    <<フードプレゼンテーションのご案内>>

    • 7:00 – 10:00 ご朝食
    • 11:00 – 14:00 お昼のご軽食
    • 14:30 – 16:30 アフタヌーンティー
    • 17:00 – 19:30 ご夕食前のオードブル
    • 20:00 – 22:00 ナイトキャップ(スイーツ)

    楽しみ方

    チェックインの後は、このままクラブラウンジでゆっくりしてもいいし、部屋に向かってもいい。クラブラウンジには、いつ行っても出迎えてくれるので、好きなドリンクやオードブルを楽しめる。

    クラプラウンジの広さは、70席程(4人掛けのテープが4-5つ)あり、中央には、デラックスなソフォーが円形で4当分に区分されてあり、1の区画に4名程度まで座れる.2名様でも、どちらでもどうぞ言われれば、臆せずチョイス。
    食事は基本的に軽食である。昼、アフタヌーン、夕、夜、朝と5種類の食事とドリンクが提供される。朝はおかゆなど一般的な日本の朝食、夜ピラフなども提供されるので、基本的にその他の食事として外食することもない。

    この記事を書いたのが、2019/7で行ってきた内容でしたが、その後、2019/12、2020/12にも、家族でこのプランを使って行ってきました。以下の関連記事もご覧ください。

    2020/12は、コロナ禍であったことで、クラブラウンジでのビュッフェは無くなり、一品注文でしたが、いつもより高級な食材が使われたメニューであったことから、更に贅沢を感じられた。大阪で最も高級と思われるのは、St. REGIS OSAKAであることは、宿泊費から考えると疑う余地はないのですが、イギリス風の内装とその古さ感、調度品、などでは、贅沢をしている感覚を得られるのは、やっぱり、ザ・リッツ・カールトン大阪だ。

    1Fロビーの暖炉の部屋

    クラブラウンジ

    アフタヌーンティ

    英国様式のアフタヌーンティを頂きます。大阪では、これほど豪華なアフタヌーンティは、他にはありません。ゆっくりと楽しみます。

    軽食

    ディナーにはなっていませんが、十二分過ぎるメニューです。ブュッフェなので、好きなだけ頂けます。

    夜の時間帯には、お酒とオードブルが振る舞われます。ゆっこく過ごしてください。

    景色

    手見上げ

    毎年、特典付きのプランがあり、手見上げが頂けます。

    ザ・リッツ・カールトン大阪のクラブラウンジで楽しむアフタヌーンティーは、本場イギリスの伝統を感じさせる上質な空間と、繊細なスイーツ・セイボリーが魅力。紅茶の種類も豊富で、スタッフの丁寧なサービスにより、日常を忘れさせる優雅なひとときを過ごせました。格式あるホテルならではの落ち着いた雰囲気と、心からのおもてなしに癒され、また訪れたくなる特別な体験でした。

    スイーツとセイボリーの一般的な解説

    • スイーツ(Sweet)
      • 一口サイズのプティガトー(小さなケーキ)
      • マカロン、タルト、ムースなど
      • 季節のフルーツや素材を活かした繊細な甘さのもの
    • セイボリー(Savory)
      • スモークサーモンやパテを使ったカナッペ
      • サンドイッチ(例:キューカンバーサンド=きゅうりサンド)
      • ミニキッシュ、スコーンなど塩気を含んだ料理

    いずれもサイズ感が小さく、紅茶と合わせて楽しめるように見た目も美しく計算されており、風味や口当たりにも繊細さが感じられるのが特徴です。

    以上

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  • [Bio-Edu] rAAV vectorの製造・品質に関するリフレクションペーパー – [2019/07/21]

    [Bio-Edu] rAAV vectorの製造・品質に関するリフレクションペーパー – [2019/07/21]

    ID1065

    リフレクションペーパー

    リフレクションペーパーとは、その後成熟してガイドラインとなる。

    日本のpmdaは、遺伝子治療用製品についてのリフレクションペーパー(総19ページ)を発行した。

    参考となる欧米ガイドライン

    Guideline on the quality, non-clinical and clinical aspects of gene therapy medicinal products – 22 March 2018 EMA/CAT/80183/2014 – EUROPEAN MEDICINES AGENCY –

    1. Draft at April 2014
    2. Adoption by CAT at February 2018
    3. Adoption by CHMP at March 2018

    https://www.ema.europa.eu/en/documents/scientific-guideline/guideline-quality-non-clinical-clinical-aspects-gene-therapy-medicinal-products_en.pdf

    EMA, 2011, 遺伝子治療用製品の設計変更

    FDA, 2018, 遺伝子治療用製品の製法変更を含めた考え方をしめしたが、基本的にはバイオ医薬品のICH Q5Eに沿った同等性評価を求めている。

    • ベクターゲノムのIntegryty
    • ベクターの翻訳後修飾
    • 安全性評価: 感染細胞での持続発現性
    • カルタヘナ対応

    ispe.gr.jp – EMAからの最新のガイドライン

    https://www.ispe.gr.jp/ISPE/05_fda_issue/05_08.htm

    Cellular & Gene Therapy Guidances

    関連のガイダンスが1998年から最新の2020までが収録されている

    1. Vectorに関して3件
    2. 製造関連で2件
    3. Human Cellに関して3件
    4. その他

    https://www.fda.gov/vaccines-blood-biologics/biologics-guidances/cellular-gene-therapy-guidances

    編集履歴

    2019/07/21, Mr. Harikiri